167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2067 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  99.43 
 
 
348 aa  723    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  100 
 
 
348 aa  726    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  99.71 
 
 
348 aa  725    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  100 
 
 
348 aa  726    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1260  dihydroorotase  89.37 
 
 
348 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.374418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  100 
 
 
348 aa  726    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2209  dihydroorotase  89.66 
 
 
348 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194064  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1441  dihydroorotase  99.43 
 
 
348 aa  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.426148  normal  0.0213207 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  726    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1275  dihydroorotase  88.51 
 
 
348 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.78408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1231  dihydroorotase  89.66 
 
 
348 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.905188  normal  0.395002 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  100 
 
 
348 aa  726    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1576  dihydroorotase  88.79 
 
 
348 aa  656    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2025  dihydroorotase  89.37 
 
 
348 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2265  dihydroorotase  98.85 
 
 
348 aa  719    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  74.93 
 
 
347 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  74.06 
 
 
348 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  72.13 
 
 
348 aa  548  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  71.84 
 
 
348 aa  544  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  73.78 
 
 
347 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  71.84 
 
 
348 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  71.18 
 
 
349 aa  524  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  69.36 
 
 
347 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3231  dihydroorotase  65.61 
 
 
351 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0441  dihydroorotase  61.34 
 
 
364 aa  456  1e-127  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.373493  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  61.11 
 
 
346 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  62.31 
 
 
340 aa  424  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  61.4 
 
 
348 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0005  dihydroorotase  55.52 
 
 
354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5321  dihydroorotase  58.6 
 
 
359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06241  dihydroorotase  55.52 
 
 
354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104893  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  56.73 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  55.85 
 
 
348 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  56.43 
 
 
348 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  57.14 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  55.85 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  55.85 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  56.43 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  55.49 
 
 
346 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  54.05 
 
 
346 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  56.43 
 
 
348 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05731  dihydroorotase  53.82 
 
 
357 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.501283  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  54.94 
 
 
347 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  56.85 
 
 
354 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  56.27 
 
 
344 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  56.85 
 
 
364 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  55.04 
 
 
347 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  55.04 
 
 
347 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  57.18 
 
 
343 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  56.85 
 
 
364 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  55.04 
 
 
347 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  59.01 
 
 
343 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  56.85 
 
 
354 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  55.85 
 
 
348 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  54.81 
 
 
355 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  54.36 
 
 
347 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0892  dihydroorotase  59.18 
 
 
343 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.930238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  54.84 
 
 
345 aa  388  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3595  dihydroorotase  55.79 
 
 
344 aa  388  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  55.29 
 
 
343 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  55 
 
 
350 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0106  dihydroorotase  58.18 
 
 
347 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  56.01 
 
 
343 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  56.21 
 
 
344 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  55.98 
 
 
354 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  55.72 
 
 
344 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  56.1 
 
 
346 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  55.49 
 
 
343 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  54.07 
 
 
348 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  55.72 
 
 
344 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  54.41 
 
 
342 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  55.26 
 
 
364 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3761  dihydroorotase  56.08 
 
 
344 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.793108  hitchhiker  0.00208859 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  54.41 
 
 
342 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  54.91 
 
 
355 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  55.26 
 
 
354 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  55.52 
 
 
347 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18131  dihydroorotase  56.45 
 
 
354 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  53.98 
 
 
348 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  54.68 
 
 
344 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  56.55 
 
 
345 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  55.1 
 
 
352 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  55.1 
 
 
378 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  55.22 
 
 
350 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  55.1 
 
 
352 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  55.1 
 
 
352 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  55.39 
 
 
352 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  55.1 
 
 
352 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  55.1 
 
 
352 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  52.94 
 
 
342 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  53.71 
 
 
352 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  54.68 
 
 
343 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  53.82 
 
 
366 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  53.6 
 
 
354 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  55.13 
 
 
342 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  53.64 
 
 
359 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  53.76 
 
 
355 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  54.71 
 
 
343 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  53.94 
 
 
348 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  54.71 
 
 
343 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>