168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0569 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0569  dihydroorotase  100 
 
 
349 aa  720    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06251  dihydroorotase  92.26 
 
 
349 aa  669    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05951  dihydroorotase  92.2 
 
 
349 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06331  dihydroorotase  80.23 
 
 
349 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0005  dihydroorotase  58.79 
 
 
354 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06241  dihydroorotase  59.08 
 
 
354 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104893  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  56.94 
 
 
346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  54.94 
 
 
348 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05731  dihydroorotase  54.65 
 
 
357 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.501283  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  52.87 
 
 
348 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  53.31 
 
 
348 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  52.59 
 
 
340 aa  371  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  53.31 
 
 
348 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18131  dihydroorotase  51.74 
 
 
354 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  53.31 
 
 
348 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  53.2 
 
 
347 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0892  dihydroorotase  55.36 
 
 
343 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.930238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  52.63 
 
 
349 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  52.46 
 
 
347 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  52.17 
 
 
347 aa  362  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  50.14 
 
 
348 aa  360  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  50.14 
 
 
348 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  49.86 
 
 
348 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  49.86 
 
 
348 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  49.86 
 
 
348 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  49.86 
 
 
348 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  49.86 
 
 
348 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2265  dihydroorotase  50.14 
 
 
348 aa  359  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1441  dihydroorotase  49.86 
 
 
348 aa  359  5e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.426148  normal  0.0213207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2209  dihydroorotase  51.01 
 
 
348 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194064  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2025  dihydroorotase  51.01 
 
 
348 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1231  dihydroorotase  51.01 
 
 
348 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.905188  normal  0.395002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5321  dihydroorotase  50.58 
 
 
359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1260  dihydroorotase  50.72 
 
 
348 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.374418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1275  dihydroorotase  50.72 
 
 
348 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.78408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1576  dihydroorotase  50.14 
 
 
348 aa  354  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3231  dihydroorotase  50.58 
 
 
351 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  50.14 
 
 
346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  51.01 
 
 
355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  50.14 
 
 
345 aa  351  8e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  50.14 
 
 
345 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  49.86 
 
 
344 aa  348  7e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  49.86 
 
 
344 aa  347  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4467  dihydroorotase  50 
 
 
347 aa  346  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506295  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  51.44 
 
 
347 aa  345  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  51.44 
 
 
347 aa  345  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  51.44 
 
 
347 aa  345  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  50.57 
 
 
343 aa  345  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  49.42 
 
 
364 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  49.42 
 
 
364 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  49.71 
 
 
345 aa  344  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  50.14 
 
 
344 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  49.13 
 
 
354 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  50.87 
 
 
344 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  49.85 
 
 
344 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  50.14 
 
 
348 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  48.42 
 
 
351 aa  342  5e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  49.86 
 
 
348 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  51.15 
 
 
343 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  49.71 
 
 
348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  48.14 
 
 
348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0441  dihydroorotase  47.84 
 
 
364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.373493  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  49.57 
 
 
346 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  51.15 
 
 
343 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  51.15 
 
 
343 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  48.55 
 
 
354 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  49.85 
 
 
346 aa  339  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  48.84 
 
 
354 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  51.72 
 
 
343 aa  338  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  47.44 
 
 
347 aa  338  7e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  48 
 
 
353 aa  338  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  49.43 
 
 
350 aa  338  8e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  48.29 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1930  dihydroorotase  46.88 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0129  dihydroorotase  46.69 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.969204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  48.84 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  48.55 
 
 
348 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  50.29 
 
 
366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  48.55 
 
 
344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  50.86 
 
 
343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  48.55 
 
 
348 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  47.85 
 
 
352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  47.85 
 
 
378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  47.85 
 
 
352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  47.85 
 
 
352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  47.85 
 
 
352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  47.85 
 
 
352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  48.99 
 
 
347 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  47.85 
 
 
352 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  47.99 
 
 
354 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0581  dihydroorotase  46.88 
 
 
346 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  48.26 
 
 
348 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  48.84 
 
 
344 aa  335  7.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  47.54 
 
 
347 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0524  dihydroorotase  46.09 
 
 
350 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  48.56 
 
 
342 aa  332  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  46.69 
 
 
346 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  47.43 
 
 
346 aa  332  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  48.41 
 
 
343 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  48.55 
 
 
348 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>