163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1427 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  100 
 
 		 340 aa  689    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  72.01 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  64.69 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  61.42 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  62.61 
 
 		 347 aa  435  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0892  dihydroorotase  66.67 
 
 		 343 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.930238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1576  dihydroorotase  62.91 
 
 		 348 aa  431  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1231  dihydroorotase  62.83 
 
 		 348 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.905188  normal  0.395002 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  61.13 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  62.31 
 
 		 348 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1275  dihydroorotase  63.13 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.78408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  61.06 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2025  dihydroorotase  62.83 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  60.83 
 
 		 349 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  62.31 
 
 		 348 aa  424  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  62.31 
 
 		 348 aa  424  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  62.31 
 
 		 348 aa  424  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  62.31 
 
 		 348 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2209  dihydroorotase  62.83 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194064  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1260  dihydroorotase  63.13 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.374418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  61.72 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  62.02 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1441  dihydroorotase  61.95 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.426148  normal  0.0213207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2265  dihydroorotase  61.36 
 
 		 348 aa  421  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0005  dihydroorotase  57.85 
 
 		 354 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05731  dihydroorotase  57.68 
 
 		 357 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  62.5 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  59.59 
 
 		 348 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  61.99 
 
 		 344 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  62.5 
 
 		 378 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3231  dihydroorotase  60.65 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  62.5 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06241  dihydroorotase  57.27 
 
 		 354 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18131  dihydroorotase  58.91 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  62.5 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  62.21 
 
 		 352 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  62.5 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  62.5 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  63.08 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  61.92 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  59 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  61.7 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  61.99 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  59.59 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  61.7 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  61.7 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  59 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  59.88 
 
 		 348 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  59.88 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  59.01 
 
 		 348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  61.4 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  60.82 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  59.88 
 
 		 344 aa  401  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  59.42 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  59.06 
 
 		 366 aa  401  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  60.29 
 
 		 346 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  61.11 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  61.7 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  61.11 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  60.06 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  59.59 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  58.84 
 
 		 353 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  60.17 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  60.23 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  59.88 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  59.59 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  59.18 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  59.18 
 
 		 347 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  58.36 
 
 		 345 aa  394  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  58.26 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5321  dihydroorotase  60.47 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2371  dihydroorotase  57.73 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.860009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  59.01 
 
 		 348 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  59.3 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  60.42 
 
 		 350 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  57.18 
 
 		 345 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  60.71 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  56.1 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  56.4 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  57.27 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0441  dihydroorotase  53.98 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.373493  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  55.98 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  56.77 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  57.85 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  58.02 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06251  dihydroorotase  52.91 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05951  dihydroorotase  52.3 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1930  dihydroorotase  57.31 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  55.56 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  59.48 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  57.06 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  56.4 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  55.81 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  58.11 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  58.36 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06331  dihydroorotase  51.74 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0581  dihydroorotase  57.6 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27192  predicted protein  56.76 
 
 		 382 aa  376  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150443 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29717  Dihydroorotase, mitochondrial precursor  56.76 
 
 		 382 aa  376  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302162  normal  0.0124801 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  57.31 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>