171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0005 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0005  dihydroorotase  100 
 
 
354 aa  733    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06241  dihydroorotase  98.02 
 
 
354 aa  719    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104893  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  63.9 
 
 
348 aa  468  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05731  dihydroorotase  61.54 
 
 
357 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.501283  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18131  dihydroorotase  60.4 
 
 
354 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0569  dihydroorotase  58.79 
 
 
349 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06251  dihydroorotase  57.93 
 
 
349 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06331  dihydroorotase  57.64 
 
 
349 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05951  dihydroorotase  57.97 
 
 
349 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  57.85 
 
 
340 aa  418  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0892  dihydroorotase  61.1 
 
 
343 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.930238  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  57.85 
 
 
346 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  55.52 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  55.52 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  55.81 
 
 
348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  55.52 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  55.81 
 
 
348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1441  dihydroorotase  55.52 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.426148  normal  0.0213207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  55.52 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  55.52 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2265  dihydroorotase  55.81 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1231  dihydroorotase  54.55 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.905188  normal  0.395002 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1260  dihydroorotase  54.83 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.374418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  53.78 
 
 
347 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2025  dihydroorotase  54.83 
 
 
348 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  53.41 
 
 
353 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  54.49 
 
 
344 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1275  dihydroorotase  54.26 
 
 
348 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.78408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5321  dihydroorotase  55.04 
 
 
359 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2209  dihydroorotase  54.55 
 
 
348 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194064  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  55.08 
 
 
352 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  54.42 
 
 
347 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  53.41 
 
 
353 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  53.98 
 
 
348 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  54.8 
 
 
352 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  53.69 
 
 
348 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  54.49 
 
 
344 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  54.8 
 
 
378 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  53.69 
 
 
354 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  53.41 
 
 
348 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  53.69 
 
 
364 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  53.69 
 
 
364 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  54.42 
 
 
347 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  54.8 
 
 
352 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  53.69 
 
 
354 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  54.8 
 
 
352 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  54.8 
 
 
352 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  54.8 
 
 
352 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  53.41 
 
 
348 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  53.41 
 
 
354 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  53.89 
 
 
352 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  53.12 
 
 
354 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  54.18 
 
 
345 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  52.14 
 
 
346 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  53.94 
 
 
349 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  52.89 
 
 
346 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1576  dihydroorotase  53.69 
 
 
348 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  51.59 
 
 
344 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  51.72 
 
 
366 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  52.33 
 
 
344 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3231  dihydroorotase  52.42 
 
 
351 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  54.09 
 
 
344 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  52.33 
 
 
344 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  51.59 
 
 
345 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  51.3 
 
 
345 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  52.29 
 
 
354 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  52 
 
 
364 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  51.85 
 
 
346 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  50.28 
 
 
351 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  49.86 
 
 
355 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  51.58 
 
 
347 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  53.25 
 
 
347 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  52.16 
 
 
348 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  50.29 
 
 
348 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  51.45 
 
 
344 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  52.72 
 
 
345 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  50.43 
 
 
347 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  52.96 
 
 
350 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  50.87 
 
 
348 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  50.43 
 
 
343 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  50.58 
 
 
348 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1930  dihydroorotase  51.86 
 
 
346 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  50.72 
 
 
348 aa  361  9e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  51.15 
 
 
355 aa  361  9e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  50.29 
 
 
347 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  51.59 
 
 
355 aa  360  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  50.14 
 
 
359 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  51.01 
 
 
348 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  50.29 
 
 
347 aa  360  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  51.86 
 
 
346 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  49.71 
 
 
348 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  52.45 
 
 
347 aa  359  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  52.89 
 
 
345 aa  359  5e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0129  dihydroorotase  52.91 
 
 
346 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.969204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0106  dihydroorotase  49.57 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  50.57 
 
 
346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  49.42 
 
 
348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  49.13 
 
 
348 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  49.13 
 
 
348 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0581  dihydroorotase  50.57 
 
 
346 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>