182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0675 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  90.29 
 
 
352 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  92.31 
 
 
364 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  90.29 
 
 
378 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  99.15 
 
 
354 aa  716    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  90.29 
 
 
352 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  99.72 
 
 
354 aa  720    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  100 
 
 
364 aa  741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  91.53 
 
 
354 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  100 
 
 
364 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  90.29 
 
 
352 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  95.48 
 
 
354 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  90.29 
 
 
352 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  90 
 
 
352 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  90.29 
 
 
352 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  90.29 
 
 
352 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  87.25 
 
 
354 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  85.84 
 
 
353 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  85.27 
 
 
353 aa  621  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  79.82 
 
 
344 aa  557  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  78.95 
 
 
344 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  79.24 
 
 
344 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  79.18 
 
 
344 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  78.89 
 
 
344 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  72.24 
 
 
355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  72.03 
 
 
355 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  72.89 
 
 
344 aa  508  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  72.99 
 
 
348 aa  508  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  71.43 
 
 
343 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  70.64 
 
 
366 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  67.13 
 
 
359 aa  484  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  68.8 
 
 
347 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  67.72 
 
 
346 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  65.31 
 
 
347 aa  474  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  69.53 
 
 
347 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  67.43 
 
 
347 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  69.53 
 
 
350 aa  477  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  65.79 
 
 
345 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  65.2 
 
 
345 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  64.67 
 
 
352 aa  472  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  65.42 
 
 
346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  66.28 
 
 
345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  65.99 
 
 
343 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  68.31 
 
 
345 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  67.15 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  66.96 
 
 
348 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  66.96 
 
 
348 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  66.47 
 
 
348 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  66.67 
 
 
343 aa  464  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  64.14 
 
 
344 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  64.72 
 
 
345 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  65.61 
 
 
348 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  64.74 
 
 
348 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  65.03 
 
 
347 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  60.93 
 
 
344 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  64.04 
 
 
342 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  64.74 
 
 
348 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  64.45 
 
 
347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  63.16 
 
 
348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  64.45 
 
 
348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  61.52 
 
 
347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  61.52 
 
 
347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  61.52 
 
 
347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  60.93 
 
 
343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  62.39 
 
 
343 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  62.32 
 
 
348 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  63.74 
 
 
347 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  62.1 
 
 
343 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  62.1 
 
 
343 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  61.52 
 
 
343 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  61.52 
 
 
343 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  59.24 
 
 
342 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  58.43 
 
 
355 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  58.02 
 
 
343 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  64.43 
 
 
345 aa  428  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  61.27 
 
 
350 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  57.51 
 
 
347 aa  425  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  59.18 
 
 
342 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  58.89 
 
 
342 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  61.45 
 
 
346 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  61.4 
 
 
342 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  59.65 
 
 
359 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  59.01 
 
 
349 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  60.35 
 
 
345 aa  418  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  60.06 
 
 
343 aa  414  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  61.22 
 
 
343 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  56.73 
 
 
351 aa  411  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1660  dihydroorotase  55.41 
 
 
373 aa  412  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000732749  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  59.01 
 
 
348 aa  412  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  58.31 
 
 
347 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  61.7 
 
 
340 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  56.43 
 
 
348 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  56.48 
 
 
347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27192  predicted protein  58.43 
 
 
382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0150443 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29717  Dihydroorotase, mitochondrial precursor  58.43 
 
 
382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302162  normal  0.0124801 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  59.59 
 
 
346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2371  dihydroorotase  58.72 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.860009  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  55.62 
 
 
348 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19692  predicted protein  55.74 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  55.33 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  54.76 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>