181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0589 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  100 
 
 		 345 aa  715    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3761  dihydroorotase  87.21 
 
 		 344 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.793108  hitchhiker  0.00208859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3595  dihydroorotase  86.05 
 
 		 344 aa  608  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  86.38 
 
 		 345 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0584  dihydroorotase  79.59 
 
 		 344 aa  558  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  74.2 
 
 		 348 aa  550  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  72.01 
 
 		 343 aa  541  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  64.62 
 
 		 348 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  64.33 
 
 		 348 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  63.45 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  63.16 
 
 		 348 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  63.56 
 
 		 347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  63.85 
 
 		 347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  62.87 
 
 		 348 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  62.9 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  63.48 
 
 		 348 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  61.4 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  61 
 
 		 348 aa  441  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  64.52 
 
 		 343 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  61.29 
 
 		 344 aa  435  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  60.47 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  60.47 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  60.47 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  59.88 
 
 		 343 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  59.18 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  60.77 
 
 		 359 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  62.24 
 
 		 348 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  61.16 
 
 		 350 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  60.17 
 
 		 342 aa  424  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  60.87 
 
 		 342 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  60.47 
 
 		 343 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  59.29 
 
 		 346 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  60.93 
 
 		 366 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  60.47 
 
 		 343 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  59.94 
 
 		 353 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  60.47 
 
 		 343 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  60.76 
 
 		 342 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  60.47 
 
 		 343 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  60.17 
 
 		 343 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  59.83 
 
 		 344 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  60.06 
 
 		 354 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  59.37 
 
 		 353 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  60.35 
 
 		 364 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  60.35 
 
 		 364 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  58.77 
 
 		 343 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  58.89 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  60.35 
 
 		 354 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  57.85 
 
 		 342 aa  418  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  60.29 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  60 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  60 
 
 		 378 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  60.29 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  58.21 
 
 		 347 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  59.88 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  60.88 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  60 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  60.59 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  60.06 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  60 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  59.42 
 
 		 342 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  59.71 
 
 		 352 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  60 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  60 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  58.6 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  58.43 
 
 		 345 aa  411  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  58.6 
 
 		 347 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  56.56 
 
 		 345 aa  411  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  58.77 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  59.65 
 
 		 354 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  58.77 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  59.65 
 
 		 364 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  57.27 
 
 		 359 aa  408  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  59.58 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  59.28 
 
 		 350 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  58.53 
 
 		 343 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  56.6 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  57.35 
 
 		 346 aa  401  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  56.89 
 
 		 347 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  56.89 
 
 		 349 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  58.36 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  56.27 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  56.76 
 
 		 344 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  56.01 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  57.93 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  55.72 
 
 		 348 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  58.31 
 
 		 345 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  56.36 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  55.72 
 
 		 348 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  56.27 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2209  dihydroorotase  55.43 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194064  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  56.2 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2025  dihydroorotase  55.43 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  56.65 
 
 		 346 aa  391  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  57.43 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1231  dihydroorotase  55.13 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.905188  normal  0.395002 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1260  dihydroorotase  55.43 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.374418 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  54.84 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  54.84 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  54.84 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  56.27 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>