187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3595 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  92.73 
 
 		 345 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3761  dihydroorotase  93.31 
 
 		 344 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.793108  hitchhiker  0.00208859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3595  dihydroorotase  100 
 
 		 344 aa  709    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  86.05 
 
 		 345 aa  627  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0584  dihydroorotase  77.33 
 
 		 344 aa  544  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  71.14 
 
 		 343 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  72.59 
 
 		 348 aa  540  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  64.04 
 
 		 348 aa  461  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  62.97 
 
 		 347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  62.39 
 
 		 347 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  62.57 
 
 		 348 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  62.87 
 
 		 348 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  62.28 
 
 		 348 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  62.28 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  62.87 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  62.57 
 
 		 348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  60.53 
 
 		 348 aa  441  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  63.93 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  60.47 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  60.47 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  60.47 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  59.88 
 
 		 343 aa  434  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  60.41 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  61.34 
 
 		 342 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  61.05 
 
 		 343 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  61.05 
 
 		 343 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  59.71 
 
 		 342 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  60.76 
 
 		 342 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  57.6 
 
 		 343 aa  421  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  61.05 
 
 		 343 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  61.05 
 
 		 343 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  59.53 
 
 		 344 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  59.88 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  58.55 
 
 		 344 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  58.6 
 
 		 345 aa  417  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  58.41 
 
 		 346 aa  414  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  58.06 
 
 		 359 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  59.88 
 
 		 350 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  58.82 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  60.18 
 
 		 347 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  60.18 
 
 		 348 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  57.14 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  59.13 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  57.73 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  58.89 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  58.55 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  57.85 
 
 		 342 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  57.44 
 
 		 349 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  56.97 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  59.12 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  58.96 
 
 		 344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  56.69 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  59.12 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  59.41 
 
 		 344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  58.06 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  56.38 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  56.38 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1441  dihydroorotase  56.38 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.426148  normal  0.0213207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  57.97 
 
 		 353 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  56.38 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  56.38 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  57.23 
 
 		 346 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  56.2 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  57.35 
 
 		 353 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  57.51 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  56.38 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  55.69 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  56.38 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  56.08 
 
 		 348 aa  398  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  58.26 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  58.26 
 
 		 378 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  58.31 
 
 		 354 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  58.02 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  58.55 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  54.81 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2265  dihydroorotase  56.08 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  55.88 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  58.31 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  55.65 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  58.31 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  58.26 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  55.65 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  58.26 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  57.97 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  58.26 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  58.26 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1260  dihydroorotase  56.25 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.374418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2209  dihydroorotase  55.65 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194064  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  55.59 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1231  dihydroorotase  55.65 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.905188  normal  0.395002 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  57.73 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  56.69 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  56.47 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  57.89 
 
 		 354 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2025  dihydroorotase  55.95 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  55.36 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  56.65 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  57.14 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1275  dihydroorotase  55.36 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.78408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  56.2 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>