172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0728 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  100 
 
 		 342 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  84.84 
 
 		 347 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  84.84 
 
 		 347 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  84.84 
 
 		 347 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  84.84 
 
 		 343 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  83.04 
 
 		 342 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  85.13 
 
 		 343 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  84.55 
 
 		 343 aa  591  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  84.84 
 
 		 343 aa  591  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  84.84 
 
 		 343 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  84.55 
 
 		 343 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  79.53 
 
 		 344 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  75.44 
 
 		 350 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  74.27 
 
 		 342 aa  531  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  72.51 
 
 		 342 aa  531  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  73.39 
 
 		 342 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  72.35 
 
 		 343 aa  520  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  72.94 
 
 		 348 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  70.8 
 
 		 355 aa  495  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  70.18 
 
 		 347 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  69.41 
 
 		 348 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  70.18 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  69.12 
 
 		 348 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  69.12 
 
 		 348 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  68.53 
 
 		 348 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  68.24 
 
 		 359 aa  481  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  68.53 
 
 		 348 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  68.24 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  67.94 
 
 		 348 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  65.88 
 
 		 348 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  64.43 
 
 		 366 aa  461  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  65.69 
 
 		 344 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  65.09 
 
 		 344 aa  461  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  64.5 
 
 		 344 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  62.5 
 
 		 345 aa  455  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  65.59 
 
 		 343 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  64.5 
 
 		 344 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  64.2 
 
 		 344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  64.6 
 
 		 344 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  63.45 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  61.95 
 
 		 347 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  61.99 
 
 		 355 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  61.7 
 
 		 354 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  60.76 
 
 		 345 aa  435  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  60.82 
 
 		 353 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  61.4 
 
 		 354 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  59.65 
 
 		 346 aa  431  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  61.34 
 
 		 348 aa  433  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  61.4 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  61.4 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  61.24 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  61.18 
 
 		 355 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  61.95 
 
 		 346 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  62.68 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  60 
 
 		 353 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  61 
 
 		 348 aa  428  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  59.94 
 
 		 352 aa  428  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  59.71 
 
 		 343 aa  428  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  61.34 
 
 		 345 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  61.52 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  61.52 
 
 		 378 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  60.53 
 
 		 354 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  60.53 
 
 		 354 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  59.88 
 
 		 346 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  60.47 
 
 		 343 aa  424  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  61.52 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  61.52 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3595  dihydroorotase  60.17 
 
 		 344 aa  424  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  61.81 
 
 		 352 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  61.52 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  61.52 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  58.43 
 
 		 351 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  60.12 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  60.9 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  60.06 
 
 		 343 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  59.71 
 
 		 345 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  61.22 
 
 		 352 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3761  dihydroorotase  59.3 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.793108  hitchhiker  0.00208859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  58.31 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  59.41 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  60.9 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  61.06 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  58.02 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  57.77 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0584  dihydroorotase  59.71 
 
 		 344 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  58.48 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27192  predicted protein  58.36 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150443 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29717  Dihydroorotase, mitochondrial precursor  58.36 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302162  normal  0.0124801 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  58.14 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  57.31 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  58.94 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  55.72 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  58.94 
 
 		 364 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  57.27 
 
 		 349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19692  predicted protein  58.14 
 
 		 356 aa  406  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  56.89 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1660  dihydroorotase  57.18 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000732749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  55.29 
 
 		 348 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  55.59 
 
 		 348 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  55 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>