204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1369 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  100 
 
 		 345 aa  711    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  99.42 
 
 		 345 aa  709    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  66.37 
 
 		 347 aa  488  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  65.41 
 
 		 366 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  66.86 
 
 		 344 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  64.62 
 
 		 345 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  65.2 
 
 		 354 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  65.2 
 
 		 354 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  65.69 
 
 		 344 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  65.5 
 
 		 354 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  65.2 
 
 		 364 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  65.2 
 
 		 364 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  62.14 
 
 		 354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  62.39 
 
 		 353 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  65.69 
 
 		 345 aa  463  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  61.27 
 
 		 353 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  64.24 
 
 		 344 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  65.4 
 
 		 345 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  62.5 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  64.14 
 
 		 343 aa  455  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  62.5 
 
 		 352 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  62.76 
 
 		 344 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  62.5 
 
 		 344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  62.21 
 
 		 352 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  62.21 
 
 		 378 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  63.05 
 
 		 344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  63.82 
 
 		 354 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  63.82 
 
 		 364 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  62.21 
 
 		 352 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  62.21 
 
 		 352 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  62.21 
 
 		 352 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  62.21 
 
 		 352 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  63.5 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  59.94 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  60.59 
 
 		 346 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  60.47 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  61.18 
 
 		 359 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  60.76 
 
 		 355 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  62.54 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  61.63 
 
 		 344 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  60.17 
 
 		 348 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  61.05 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  60.18 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  58.94 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  60.76 
 
 		 348 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  59.88 
 
 		 348 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  60.17 
 
 		 343 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  59.3 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  59.06 
 
 		 351 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  59.59 
 
 		 346 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  57.23 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  59.88 
 
 		 350 aa  425  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  59.88 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  59.88 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  59.88 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  57.85 
 
 		 343 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  58.77 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  59.88 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  58.43 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  60.83 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  56.34 
 
 		 342 aa  421  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  58.72 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  59.82 
 
 		 350 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  59.82 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  59.53 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  59.53 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  58.53 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  58.41 
 
 		 342 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  60.77 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  58.7 
 
 		 342 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  57.64 
 
 		 352 aa  418  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  59.36 
 
 		 343 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  58.72 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  57.73 
 
 		 343 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  57.14 
 
 		 359 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  59.29 
 
 		 343 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  59.41 
 
 		 342 aa  411  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  58.7 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  58.7 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  58.7 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27192  predicted protein  56.47 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150443 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29717  Dihydroorotase, mitochondrial precursor  56.47 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302162  normal  0.0124801 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  56.89 
 
 		 347 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  56.1 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  58.75 
 
 		 345 aa  388  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  53.73 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  54.23 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0581  dihydroorotase  54.65 
 
 		 346 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  52.48 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1930  dihydroorotase  54.65 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  53.96 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  53.78 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0005  dihydroorotase  51.3 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  53.94 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  53.64 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  53.91 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06241  dihydroorotase  51.01 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19692  predicted protein  53.35 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  53.8 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0584  dihydroorotase  53.06 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>