164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4319 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  100 
 
 
359 aa  734    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  82.32 
 
 
346 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  81.66 
 
 
355 aa  596  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  81.92 
 
 
355 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  83.33 
 
 
350 aa  588  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  83.33 
 
 
347 aa  586  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  79.71 
 
 
347 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  79.13 
 
 
348 aa  568  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  76.7 
 
 
343 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  76.11 
 
 
347 aa  545  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  75.07 
 
 
344 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  73.45 
 
 
344 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  72.27 
 
 
344 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  70.85 
 
 
344 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  70.47 
 
 
344 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  69.34 
 
 
354 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  70.18 
 
 
344 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  67.05 
 
 
353 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  67.13 
 
 
354 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  67.13 
 
 
364 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  67.13 
 
 
364 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  67.13 
 
 
354 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  66.48 
 
 
353 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  66.29 
 
 
354 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  69.28 
 
 
352 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  68.26 
 
 
378 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  69.28 
 
 
352 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  69.28 
 
 
352 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  68.99 
 
 
352 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  69.28 
 
 
352 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  69.28 
 
 
352 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  65.32 
 
 
346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  65.03 
 
 
366 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  67.43 
 
 
352 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  64.61 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  64.33 
 
 
364 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  64.81 
 
 
345 aa  454  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  63.93 
 
 
346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  64.41 
 
 
347 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  63.01 
 
 
348 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  63.29 
 
 
348 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  64.12 
 
 
347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  63.82 
 
 
348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  62.57 
 
 
344 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  61.18 
 
 
347 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  62.72 
 
 
348 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  63.64 
 
 
345 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  61.85 
 
 
348 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  61.47 
 
 
345 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  61.11 
 
 
347 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  61.11 
 
 
347 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  61.11 
 
 
347 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  61.76 
 
 
348 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  63.53 
 
 
343 aa  434  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  61.56 
 
 
348 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  63.19 
 
 
352 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  61.18 
 
 
345 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  60.47 
 
 
343 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  62.06 
 
 
348 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  58.58 
 
 
342 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  60.12 
 
 
348 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  61.83 
 
 
350 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  63.13 
 
 
345 aa  430  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  61.06 
 
 
343 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  62.35 
 
 
343 aa  428  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  60.77 
 
 
345 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  61.06 
 
 
343 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  61.06 
 
 
343 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  61.47 
 
 
348 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  60.77 
 
 
343 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  60.18 
 
 
343 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  59.36 
 
 
344 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  59.29 
 
 
342 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  59.59 
 
 
342 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  60.36 
 
 
342 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  58.06 
 
 
343 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  61.24 
 
 
342 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  58.58 
 
 
359 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  58.16 
 
 
347 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  61.83 
 
 
343 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  57.89 
 
 
343 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  59.65 
 
 
347 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  57.95 
 
 
349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3761  dihydroorotase  60 
 
 
344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.793108  hitchhiker  0.00208859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  60.47 
 
 
345 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  55.98 
 
 
351 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  53.82 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3595  dihydroorotase  58.82 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  60.23 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  57.89 
 
 
347 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  56.08 
 
 
347 aa  398  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  55.79 
 
 
347 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  59.24 
 
 
345 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  55.43 
 
 
348 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1660  dihydroorotase  56.23 
 
 
373 aa  396  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000732749  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  54.55 
 
 
348 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  56.98 
 
 
346 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  54.28 
 
 
348 aa  388  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  54.28 
 
 
348 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  59.81 
 
 
346 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>