164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0325 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1930  dihydroorotase  92.75 
 
 		 346 aa  647    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0581  dihydroorotase  93.33 
 
 		 346 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  100 
 
 		 346 aa  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  75.36 
 
 		 346 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4467  dihydroorotase  73.78 
 
 		 347 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0106  dihydroorotase  73.18 
 
 		 347 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0130  dihydroorotase  71.72 
 
 		 348 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0129  dihydroorotase  71.72 
 
 		 346 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2371  dihydroorotase  72.43 
 
 		 345 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.860009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0524  dihydroorotase  70.14 
 
 		 350 aa  504  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  68.99 
 
 		 346 aa  491  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1742  dihydroorotase  68.3 
 
 		 347 aa  484  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119262  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  60.29 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  60 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  60 
 
 		 378 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  60 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  58.84 
 
 		 353 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  60 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  60 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  60 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  60 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  59.13 
 
 		 354 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  60.23 
 
 		 344 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  58.26 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  59.36 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  59.59 
 
 		 364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  59.59 
 
 		 364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  59.59 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  59.3 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  59.59 
 
 		 354 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  58.77 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  58.77 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  59.65 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  59.36 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  59.36 
 
 		 354 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  55.65 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  55.88 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  53.91 
 
 		 355 aa  391  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  55.07 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  54.94 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  57.27 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  55.23 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  56.69 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  55.52 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  54.07 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  60.77 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  54.09 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  55.23 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  55.59 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  55.23 
 
 		 348 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  59.06 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  55.88 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  54.36 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  53.8 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  53.8 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  58.31 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  53.8 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  56.01 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  53.2 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  58.6 
 
 		 346 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  57.69 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  55.81 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  58.88 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  58.31 
 
 		 348 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  55.23 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  53.78 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  55.92 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  58.97 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  54.65 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  53.22 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  54.23 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  57.31 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  56.14 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  53.8 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  54.52 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  53.51 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  53.8 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  53.51 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  54.39 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  54.23 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  55.52 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  52.92 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  53.94 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  54.68 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  58.2 
 
 		 347 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5321  dihydroorotase  57.78 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  55.59 
 
 		 350 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  53.2 
 
 		 348 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  59.87 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  53.06 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05731  dihydroorotase  50.43 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  53.78 
 
 		 342 aa  364  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  55.81 
 
 		 345 aa  364  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  55.66 
 
 		 348 aa  364  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  55.66 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  51.87 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  55.66 
 
 		 348 aa  362  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  55.66 
 
 		 348 aa  362  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  55.66 
 
 		 348 aa  362  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  55.66 
 
 		 348 aa  362  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>