More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30885 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30885  predicted protein  100 
 
 		 806 aa  1651    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0333554  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10078  peroxisomal fatty acid ABC transporter, putative (Eurofung)  41.96 
 
 		 820 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252374  normal  0.955787 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06310  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  35.9 
 
 		 867 aa  478  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03860  adrenoleukodystrophy protein, putative  33.84 
 
 		 725 aa  411  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01014  peroxisomal fatty acid ABC transporter, putative (Eurofung)  32.04 
 
 		 706 aa  359  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186726 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_10028  ABC(ABCD) family transporter: long-chain fatty acid  30.39 
 
 		 583 aa  281  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.98374  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82035  Peroxisomal long-chain fatty acid import protein 1 (Peroxisomal ABC transporter 2)  29.51 
 
 		 689 aa  280  5e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.670256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43996  ABC(ABCD) family transporter: long-chain fatty acid (ALDP-like protein)  28.38 
 
 		 615 aa  234  6e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.4859  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  26.95 
 
 		 662 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  26.78 
 
 		 662 aa  197  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  28.85 
 
 		 563 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  28.24 
 
 		 567 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  27.8 
 
 		 662 aa  194  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  26.74 
 
 		 665 aa  185  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  27.53 
 
 		 658 aa  181  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  26.79 
 
 		 660 aa  180  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  26.39 
 
 		 660 aa  180  9e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  26.06 
 
 		 534 aa  180  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1622  ABC transporter-like  26.03 
 
 		 611 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0184099  normal  0.0800311 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  25.61 
 
 		 668 aa  176  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  29.53 
 
 		 667 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  26.07 
 
 		 589 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  25.65 
 
 		 660 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  26.41 
 
 		 667 aa  175  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  25.75 
 
 		 660 aa  173  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1617  ABC transporter-like  33.33 
 
 		 669 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.477524  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  27.08 
 
 		 608 aa  162  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  25.31 
 
 		 576 aa  161  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  38.14 
 
 		 640 aa  161  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  39.58 
 
 		 603 aa  160  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  26.11 
 
 		 576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  26.8 
 
 		 575 aa  157  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  24.91 
 
 		 570 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  37.5 
 
 		 663 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  37.5 
 
 		 663 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.9 
 
 		 587 aa  137  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  23.9 
 
 		 587 aa  137  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  33.18 
 
 		 597 aa  136  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  24.52 
 
 		 614 aa  132  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  23.4 
 
 		 704 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.19 
 
 		 598 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  32.06 
 
 		 605 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  33.83 
 
 		 626 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  33.83 
 
 		 615 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  32.37 
 
 		 606 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  24.32 
 
 		 614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  23.72 
 
 		 630 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  23.03 
 
 		 621 aa  128  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  22.82 
 
 		 583 aa  127  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  33.5 
 
 		 626 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  34.56 
 
 		 590 aa  127  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  32.27 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  22.61 
 
 		 595 aa  126  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  33 
 
 		 602 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  25.6 
 
 		 639 aa  125  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  32.32 
 
 		 595 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  24.04 
 
 		 708 aa  122  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  26.14 
 
 		 606 aa  121  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  24.95 
 
 		 712 aa  120  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  23.02 
 
 		 712 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  30.94 
 
 		 614 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  23.25 
 
 		 599 aa  119  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  23.39 
 
 		 596 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  32.71 
 
 		 614 aa  118  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  27.27 
 
 		 578 aa  118  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  22.83 
 
 		 589 aa  118  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  23.02 
 
 		 704 aa  118  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  26.87 
 
 		 713 aa  117  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  22.16 
 
 		 577 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  29.69 
 
 		 634 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  22.66 
 
 		 589 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  29.69 
 
 		 636 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  29.69 
 
 		 636 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  22.76 
 
 		 589 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  22.76 
 
 		 589 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  22.76 
 
 		 589 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  22.83 
 
 		 589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  28.46 
 
 		 610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  22.37 
 
 		 583 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  22.34 
 
 		 588 aa  114  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.06 
 
 		 549 aa  114  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  22.06 
 
 		 592 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  33.82 
 
 		 632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  23.54 
 
 		 563 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  29.82 
 
 		 660 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  31.35 
 
 		 651 aa  111  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.8 
 
 		 588 aa  111  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  28.63 
 
 		 674 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  30.27 
 
 		 636 aa  110  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2853  ABC transporter related  27.87 
 
 		 670 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2897  ABC transporter  27.87 
 
 		 670 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1675  ABC transporter, permease protein  22.33 
 
 		 571 aa  110  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0722052  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 		 588 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.56 
 
 		 584 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  32.94 
 
 		 613 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  32.43 
 
 		 591 aa  110  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.56 
 
 		 588 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  21.92 
 
 		 596 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.56 
 
 		 588 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 		 588 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>