More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_10028 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_10028  ABC(ABCD) family transporter: long-chain fatty acid  100 
 
 		 583 aa  1196    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.98374  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43996  ABC(ABCD) family transporter: long-chain fatty acid (ALDP-like protein)  39.36 
 
 		 615 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.4859  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03860  adrenoleukodystrophy protein, putative  33.55 
 
 		 725 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01014  peroxisomal fatty acid ABC transporter, putative (Eurofung)  34.27 
 
 		 706 aa  333  7.000000000000001e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186726 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06310  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  32.51 
 
 		 867 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10078  peroxisomal fatty acid ABC transporter, putative (Eurofung)  34.29 
 
 		 820 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252374  normal  0.955787 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30885  predicted protein  30.39 
 
 		 806 aa  281  3e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0333554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82035  Peroxisomal long-chain fatty acid import protein 1 (Peroxisomal ABC transporter 2)  29.44 
 
 		 689 aa  251  3e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.670256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  28.31 
 
 		 563 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  28.16 
 
 		 534 aa  210  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  30.43 
 
 		 667 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  28.99 
 
 		 575 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  28.5 
 
 		 576 aa  196  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  30.71 
 
 		 665 aa  196  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  25.96 
 
 		 567 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  28.51 
 
 		 663 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  28.51 
 
 		 663 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  26.86 
 
 		 600 aa  195  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  28.02 
 
 		 660 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  27.15 
 
 		 603 aa  189  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  28.17 
 
 		 660 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  27.42 
 
 		 660 aa  187  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  27.1 
 
 		 640 aa  187  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1617  ABC transporter-like  26.2 
 
 		 669 aa  186  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.477524  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1622  ABC transporter-like  27.32 
 
 		 611 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0184099  normal  0.0800311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  28.35 
 
 		 576 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  26.36 
 
 		 662 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  27.26 
 
 		 667 aa  184  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  28.24 
 
 		 608 aa  183  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  27.64 
 
 		 662 aa  183  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  26.17 
 
 		 662 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  27.38 
 
 		 575 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  27.07 
 
 		 660 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  27.01 
 
 		 570 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  27.24 
 
 		 589 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  28.77 
 
 		 668 aa  176  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  26.84 
 
 		 596 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  27.77 
 
 		 660 aa  170  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  28.41 
 
 		 674 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  27.2 
 
 		 658 aa  169  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  28.43 
 
 		 613 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  27 
 
 		 666 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.34 
 
 		 598 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  28.06 
 
 		 602 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.72 
 
 		 587 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  25.38 
 
 		 595 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  26.72 
 
 		 587 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  25.82 
 
 		 596 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  27.83 
 
 		 615 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  26.38 
 
 		 578 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  27.44 
 
 		 605 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  27.63 
 
 		 626 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  27.18 
 
 		 593 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  25.94 
 
 		 590 aa  160  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  27.08 
 
 		 651 aa  160  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  26.49 
 
 		 701 aa  158  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  28.27 
 
 		 597 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  27.29 
 
 		 642 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  26.39 
 
 		 712 aa  156  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  27.02 
 
 		 606 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  26.29 
 
 		 603 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  28.38 
 
 		 588 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.38 
 
 		 588 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  27.5 
 
 		 577 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  28.38 
 
 		 588 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  28.38 
 
 		 588 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.38 
 
 		 584 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  26.59 
 
 		 588 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.38 
 
 		 588 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  26.01 
 
 		 599 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.38 
 
 		 588 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  24.73 
 
 		 595 aa  153  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  27.46 
 
 		 606 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  27.46 
 
 		 589 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  27.1 
 
 		 591 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  29.19 
 
 		 579 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  26.83 
 
 		 583 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  26.74 
 
 		 610 aa  150  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  27.24 
 
 		 589 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  29.28 
 
 		 626 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  26.75 
 
 		 592 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  25.93 
 
 		 636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  27.24 
 
 		 589 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  27.03 
 
 		 621 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  26.78 
 
 		 589 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  26.78 
 
 		 589 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  26.78 
 
 		 589 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  27.84 
 
 		 586 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  26.88 
 
 		 639 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  28.04 
 
 		 614 aa  146  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  28.04 
 
 		 614 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  27.69 
 
 		 588 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  27.29 
 
 		 614 aa  145  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1675  ABC transporter, permease protein  27.25 
 
 		 571 aa  144  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0722052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  26.35 
 
 		 572 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  27.49 
 
 		 589 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  27.48 
 
 		 577 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.85 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  26.68 
 
 		 560 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2897  ABC transporter  27.48 
 
 		 670 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>