206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49486 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49486  D-glucono-1,5-lactone lactonohydrolase  100 
 
 
352 aa  736    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2611  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.94 
 
 
309 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.170386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3407  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.02 
 
 
300 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13947  normal  0.0742686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3531  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  31.11 
 
 
309 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  30.82 
 
 
300 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000545594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3664  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.18 
 
 
304 aa  123  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000466286  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1974  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.49 
 
 
302 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18647  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.16 
 
 
302 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  0.0000000314659 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00470  conserved hypothetical protein  28.66 
 
 
315 aa  120  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0048  L-arabinonolactonase  30.18 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.19 
 
 
292 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.01 
 
 
304 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.43 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2755  hypothetical protein  30.84 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.13 
 
 
281 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3209  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.21 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0193044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.1 
 
 
304 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5221  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  30.89 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5638  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.89 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4591  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.22 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.79 
 
 
330 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.15283  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0550  L-arabinonolactonase  32.2 
 
 
304 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621286  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00122  regucalcin  29.69 
 
 
303 aa  112  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235017  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1058  senescence marker protein-30 family protein  29.63 
 
 
311 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0568  regucalcin family protein  28.4 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1143  gluconolactonase  29.5 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68325  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0622  senescence marker protein-30 family protein  29.5 
 
 
311 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0845  senescence marker protein-30 family protein  29.5 
 
 
311 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1810  senescence marker protein-30 family protein  29.5 
 
 
311 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1625  senescence marker protein-30 family protein  30.43 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.3 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.93 
 
 
302 aa  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2314  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.88 
 
 
295 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122885  normal  0.0745328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0784  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.34 
 
 
302 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.34 
 
 
289 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.72815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0543  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.58 
 
 
295 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  29.72 
 
 
295 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  27.13 
 
 
300 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5842  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.35 
 
 
311 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.9 
 
 
289 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.04 
 
 
293 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  26.1 
 
 
303 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  27.58 
 
 
300 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2356  senescence marker protein-30 family protein  28.88 
 
 
311 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.17 
 
 
312 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  28.04 
 
 
291 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0500  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.26 
 
 
295 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.5 
 
 
569 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.65 
 
 
287 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0604  gluconolactonase  31.17 
 
 
288 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0638316 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.06 
 
 
291 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0840  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.08 
 
 
311 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5473  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.41 
 
 
299 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0410042 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  26.13 
 
 
300 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  26.77 
 
 
300 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0435  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.97 
 
 
294 aa  99.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.369431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.5 
 
 
318 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1592  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.93 
 
 
300 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2130  Smp-30/Cgr1 family protein, putative  27.79 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.111532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.01 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2759  regucalcin family protein  25.85 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000386621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0916  calcium-binding protein regucalcin  28.04 
 
 
293 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.62 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2046  putative Smp-30/Cgr1 family protein  27.79 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00767899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.79 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  33.49 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2670  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.06 
 
 
574 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142476  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.21 
 
 
301 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.21 
 
 
301 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4918  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.36 
 
 
299 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117058  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2259  gluconolactonase  27.52 
 
 
315 aa  96.3  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0162749  unclonable  0.0000000178231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.27 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  26.98 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41751  predicted protein  29.13 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000044531  hitchhiker  0.0048622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  26.99 
 
 
294 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  28.53 
 
 
546 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2536  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.75 
 
 
346 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3342  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.5 
 
 
294 aa  93.2  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  25.47 
 
 
294 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  26.77 
 
 
308 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02040  gluconolactonase  29.05 
 
 
298 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3180  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  28.75 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1240  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.55 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.138164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0524  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.58 
 
 
290 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0186  gluconolactonase  24 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1433  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.16 
 
 
297 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  27.65 
 
 
288 aa  90.1  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3322  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.77 
 
 
294 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  25.23 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  27.33 
 
 
288 aa  89.7  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2881  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.93 
 
 
302 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.204717  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.84 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2337  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.61 
 
 
289 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992536  normal  0.0209348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2591  gluconolactonase  27.69 
 
 
312 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000189317  normal  0.0284024 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3491  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.62 
 
 
281 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4759  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.25 
 
 
288 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0747  senescence marker protein-30 (SMP-30)  25.71 
 
 
284 aa  86.3  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  28.4 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  25 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.47 
 
 
296 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>