37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2323 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2323  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 704 aa  1419    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3599  Hemolysin-type calcium-binding region  34.65 
 
 		 585 aa  251  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3600  hypothetical protein  43.59 
 
 		 121 aa  59.3  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.59 
 
 		 2678 aa  58.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  25.61 
 
 		 2911 aa  56.2  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  26.81 
 
 		 556 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  29.77 
 
 		 764 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  28.29 
 
 		 559 aa  54.3  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  50 
 
 		 681 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  40.62 
 
 		 486 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  37.62 
 
 		 476 aa  48.9  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  27.24 
 
 		 2775 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.52 
 
 		 1236 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  28.12 
 
 		 4800 aa  48.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  31.25 
 
 		 1883 aa  47.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  32.19 
 
 		 480 aa  47.4  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  31.08 
 
 		 833 aa  47.4  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  32.87 
 
 		 481 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  51.22 
 
 		 1864 aa  47  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  34.62 
 
 		 1072 aa  47.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  36.71 
 
 		 12741 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  27.06 
 
 		 2667 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  39.08 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  31.15 
 
 		 1213 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  41.18 
 
 		 1112 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  35.71 
 
 		 490 aa  46.6  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  32.47 
 
 		 2950 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  36.9 
 
 		 2097 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  28.82 
 
 		 504 aa  45.8  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  35 
 
 		 745 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  32.74 
 
 		 476 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  26.86 
 
 		 2836 aa  45.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  42.37 
 
 		 474 aa  45.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  34.44 
 
 		 1557 aa  44.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  43.14 
 
 		 1628 aa  44.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  37.18 
 
 		 2887 aa  44.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  35.48 
 
 		 479 aa  43.9  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>