288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_17391 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_17391  endonuclease  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0783  Holliday junction resolvase YqgF  67.57 
 
 		 164 aa  192  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08311  endonuclease  53.96 
 
 		 144 aa  174  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0380749  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0199  Holliday junction resolvase YqgF  53.24 
 
 		 144 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08521  endonuclease  48.28 
 
 		 153 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.329669  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08551  endonuclease  48.28 
 
 		 153 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1870  Holliday junction resolvase YqgF  70.34 
 
 		 158 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.950837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07901  endonuclease  48.97 
 
 		 151 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0799  Holliday junction resolvase YqgF  48.97 
 
 		 153 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09701  endonuclease  57.78 
 
 		 145 aa  154  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.23747  hitchhiker  0.00428266 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2398  Holliday junction resolvase-like protein  44.44 
 
 		 149 aa  108  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0366153  hitchhiker  0.00151496 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4148  Holliday junction resolvase YqgF  43.94 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3804  Holliday junction resolvase-like protein  41.22 
 
 		 151 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0796335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2514  Holliday junction resolvase-like protein  43.61 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.36708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3098  Holliday junction resolvase-like protein  37.86 
 
 		 151 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4379  Holliday junction resolvase-like protein  39.71 
 
 		 149 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.556882  normal  0.251804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1969  Holliday junction resolvase-like protein  36.64 
 
 		 139 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0212683 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1942  Holliday junction resolvase-like protein  36.64 
 
 		 139 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0470  Holliday junction resolvase YqgF  38.06 
 
 		 141 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000599692  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1130  Holliday junction resolvase YqgF  33.83 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3892  Holliday junction resolvase-like protein  31.3 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2535  Holliday junction resolvase-like protein  35.66 
 
 		 137 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2326  Holliday junction resolvase-like protein  30.56 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3810  Holliday junction resolvase-like protein  30.15 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1232  Holliday junction resolvase-like protein  36.43 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0088  Holliday junction resolvase YqgF  34.33 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2633  Holliday junction resolvase-like protein  35.66 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0869  Holliday junction resolvase-like protein  30.88 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2727  Holliday junction resolvase-like protein  35.66 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3147  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0917  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1996  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3169  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1858  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2747  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0925  Holliday junction resolvase YqgF  36.23 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3111  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3713  Holliday junction resolvase YqgF  32.09 
 
 		 146 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0658941  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0102  Holliday junction resolvase YqgF  35.58 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1463  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0540  Holliday junction resolvase YqgF  29.93 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0775  Holliday junction resolvase YqgF  29.41 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000463594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3922  Holliday junction resolvase YqgF  34.85 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2406  Holliday junction resolvase YqgF  29.93 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.406379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3633  Holliday junction resolvase YqgF  29.71 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0510  Holliday junction resolvase-like protein  34.56 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.556579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0014  Holliday junction resolvase YqgF  32.14 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2570  Holliday junction resolvase YqgF  31.85 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00347975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2523  Holliday junction resolvase-like protein  29.73 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159244 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0836  Holliday junction resolvase-like protein  31.91 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  hitchhiker  0.00221177 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0621  Holliday junction resolvase-like protein  33.08 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0383  Holliday junction resolvase-like protein  31.91 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0865  Holliday junction resolvase-like protein  31.91 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2024  Holliday junction resolvase YqgF  31.3 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3963  Holliday junction resolvase-like protein  31.91 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1191  Holliday junction resolvase YqgF  31.88 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000237997  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0637  Holliday junction resolvase-like protein  33.58 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3035  Holliday junction resolvase YqgF  36.72 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101605  normal  0.0662243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0556  Holliday junction resolvase YqgF  34.35 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.901255  normal  0.0480752 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0474  Holliday junction resolvase YqgF  30.83 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00800439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2429  Holliday junction resolvase YqgF  31.65 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1790  Holliday junction resolvase YqgF  35.38 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00751815  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0967  Holliday junction resolvase-like protein  29.08 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0094  Holliday junction resolvase YqgF  31.82 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0018567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1518  Holliday junction resolvase-like protein  33.08 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.793177 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0423  Holliday junction resolvase-like protein  28.89 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05800  Holliday junction resolvase YqgF  30.53 
 
 		 140 aa  62  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.209228  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2684  Holliday junction resolvase-like protein  31.13 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1342  Holliday junction resolvase-like protein  31.13 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00888056  normal  0.184568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3225  Holliday junction resolvase YqgF  30.6 
 
 		 141 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2911  Holliday junction resolvase YqgF  34.06 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1640  Holliday junction resolvase YqgF  33.59 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.278901  normal  0.163549 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0597  Holliday junction resolvase-like protein  34.97 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4721  Holliday junction resolvase-like protein  32.33 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07810  conserved hypothetical protein TIGR00250  35.38 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0182311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1879  Holliday junction resolvase-like protein  30.5 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1829  Holliday junction resolvase YqgF  30.88 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0551936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1361  Holliday junction resolvase YqgF  36.43 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2162  Holliday junction resolvase YqgF  30 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0563  Holliday junction resolvase-like protein  34.36 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1360  Holliday junction resolvase-like protein  34.03 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0755  Holliday junction resolvase-like protein  30.5 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.302865  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2031  Holliday junction resolvase-like protein  26.72 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1748  Holliday junction resolvase-like protein  26.72 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0738  Holliday junction resolvase-like protein  30.5 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2265  Holliday junction resolvase YqgF  34.85 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2742  Holliday junction resolvase-like protein  29.25 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0620  Holliday junction resolvase-like protein  28.47 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0367  Holliday junction resolvase YqgF  29.8 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2015  Holliday junction resolvase YqgF  32.09 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.756916  normal  0.07881 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1024  Holliday junction resolvase YqgF  28.24 
 
 		 141 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1064  Holliday junction resolvase-like protein  30.15 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0484  Holliday junction resolvase-like protein  28.57 
 
 		 146 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0706  Holliday junction resolvase-like protein  29.63 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3314  Holliday junction resolvase YqgF  37.4 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3638  Holliday junction resolvase-like protein  25 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1714  Holliday junction resolvase-like protein  32.33 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.396791 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1427  Holliday junction resolvase-like protein  33.33 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0838  hypothetical protein  31.25 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.115372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0568  Holliday junction resolvase-like protein  27.7 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>