289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0783 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0783  Holliday junction resolvase YqgF  100 
 
 		 164 aa  325  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17391  endonuclease  67.57 
 
 		 214 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1870  Holliday junction resolvase YqgF  79.31 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.950837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08311  endonuclease  56.2 
 
 		 144 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0380749  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0199  Holliday junction resolvase YqgF  55.47 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102311  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09701  endonuclease  60.45 
 
 		 145 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.23747  hitchhiker  0.00428266 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07901  endonuclease  49.28 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08521  endonuclease  46.38 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.329669  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08551  endonuclease  46.38 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0799  Holliday junction resolvase YqgF  48.55 
 
 		 153 aa  150  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2398  Holliday junction resolvase-like protein  40.46 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0366153  hitchhiker  0.00151496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4379  Holliday junction resolvase-like protein  39.55 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.556882  normal  0.251804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3098  Holliday junction resolvase-like protein  36.17 
 
 		 151 aa  97.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4148  Holliday junction resolvase YqgF  40.15 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3804  Holliday junction resolvase-like protein  38.64 
 
 		 151 aa  95.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0796335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2514  Holliday junction resolvase-like protein  39.29 
 
 		 150 aa  94.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.36708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1942  Holliday junction resolvase-like protein  34.85 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1969  Holliday junction resolvase-like protein  34.85 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0212683 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1130  Holliday junction resolvase YqgF  33.33 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0088  Holliday junction resolvase YqgF  35.07 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0925  Holliday junction resolvase YqgF  39.55 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0423  Holliday junction resolvase-like protein  33.09 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0556  Holliday junction resolvase YqgF  33.33 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.901255  normal  0.0480752 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1438  Holliday junction resolvase YqgF  38.06 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1640  Holliday junction resolvase YqgF  36.09 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.278901  normal  0.163549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2535  Holliday junction resolvase-like protein  38.46 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52249 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0014  Holliday junction resolvase YqgF  33.57 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0470  Holliday junction resolvase YqgF  32.84 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000599692  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1191  Holliday junction resolvase YqgF  33.85 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000237997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0775  Holliday junction resolvase YqgF  32.09 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000463594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2429  Holliday junction resolvase YqgF  31.39 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1518  Holliday junction resolvase-like protein  33.6 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.793177 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0510  Holliday junction resolvase-like protein  35.07 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.556579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1714  Holliday junction resolvase-like protein  33.6 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.396791 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07810  conserved hypothetical protein TIGR00250  35.38 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0182311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3713  Holliday junction resolvase YqgF  32.06 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0658941  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1879  Holliday junction resolvase-like protein  32.84 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3035  Holliday junction resolvase YqgF  35.94 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101605  normal  0.0662243 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0597  Holliday junction resolvase-like protein  38.17 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2326  Holliday junction resolvase-like protein  31.39 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3892  Holliday junction resolvase-like protein  28.47 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2407  Holliday junction resolvase YqgF  34.62 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.664688  normal  0.90932 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0906  Holliday junction resolvase-like protein  34.88 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167999  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1165  RNase H-like ribonuclease  31.11 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2570  Holliday junction resolvase YqgF  29.63 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00347975  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0838  hypothetical protein  33.08 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.115372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0836  Holliday junction resolvase-like protein  33.33 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  hitchhiker  0.00221177 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0383  Holliday junction resolvase-like protein  33.33 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0138  Holliday junction resolvase-like protein  31.25 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2024  Holliday junction resolvase YqgF  29.23 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0865  Holliday junction resolvase-like protein  33.33 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0563  Holliday junction resolvase-like protein  37.4 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1232  Holliday junction resolvase-like protein  33.33 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1361  Holliday junction resolvase YqgF  36.03 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05800  Holliday junction resolvase YqgF  31.06 
 
 		 140 aa  62  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.209228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3225  Holliday junction resolvase YqgF  33.58 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3877  Holliday junction resolvase YqgF  30.88 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843962  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1996  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3169  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3147  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2265  Holliday junction resolvase YqgF  35.61 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0074  Holliday junction resolvase YqgF  27.41 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.974882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3810  Holliday junction resolvase-like protein  30.23 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1858  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0917  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2747  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2727  Holliday junction resolvase-like protein  32.56 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2739  Holliday junction resolvase YqgF  31.34 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3922  Holliday junction resolvase YqgF  36.76 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1768  Holliday junction resolvase-like protein  31.25 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2684  Holliday junction resolvase-like protein  31.85 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3963  Holliday junction resolvase-like protein  32.61 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1463  Holliday junction resolvase-like protein  32.64 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3633  Holliday junction resolvase YqgF  30.37 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3111  Holliday junction resolvase-like protein  31.21 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2523  Holliday junction resolvase-like protein  32.61 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159244 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0967  Holliday junction resolvase-like protein  29.85 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1342  Holliday junction resolvase-like protein  31.85 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00888056  normal  0.184568 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2633  Holliday junction resolvase-like protein  32.56 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0474  Holliday junction resolvase YqgF  28.89 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00800439  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3664  Holliday junction resolvase-like protein  35.82 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0869  Holliday junction resolvase-like protein  31.01 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2406  Holliday junction resolvase YqgF  30.08 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.406379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1829  Holliday junction resolvase YqgF  33.09 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0551936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2742  Holliday junction resolvase-like protein  30.77 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0620  Holliday junction resolvase-like protein  27.54 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0738  Holliday junction resolvase-like protein  32.61 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0755  Holliday junction resolvase-like protein  32.61 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.302865  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2162  Holliday junction resolvase YqgF  30.07 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0706  Holliday junction resolvase-like protein  29.45 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0367  Holliday junction resolvase YqgF  28.48 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0568  Holliday junction resolvase-like protein  27.54 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3157  Holliday junction resolvase YqgF  34.81 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.588989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0601  Holliday junction resolvase YqgF  34.4 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2220  Holliday junction resolvase-like protein  31.01 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000031992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2194  Holliday junction resolvase-like protein  31.01 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.401443  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0621  Holliday junction resolvase-like protein  31.54 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2090  Holliday junction resolvase-like protein  30.37 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000724166  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1064  Holliday junction resolvase-like protein  30.37 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0964  Holliday junction resolvase YqgF  34.09 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>