284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1870 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1870  Holliday junction resolvase YqgF  100 
 
 		 158 aa  310  5.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.950837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0783  Holliday junction resolvase YqgF  77.56 
 
 		 164 aa  228  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17391  endonuclease  66.24 
 
 		 214 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08311  endonuclease  56.12 
 
 		 144 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0380749  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0199  Holliday junction resolvase YqgF  55.4 
 
 		 144 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102311  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09701  endonuclease  59.7 
 
 		 145 aa  163  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.23747  hitchhiker  0.00428266 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07901  endonuclease  49.64 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08551  endonuclease  47.48 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08521  endonuclease  47.48 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.329669  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0799  Holliday junction resolvase YqgF  48.92 
 
 		 153 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2398  Holliday junction resolvase-like protein  44.03 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0366153  hitchhiker  0.00151496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3098  Holliday junction resolvase-like protein  39.58 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4379  Holliday junction resolvase-like protein  39.33 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.556882  normal  0.251804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3804  Holliday junction resolvase-like protein  41.91 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0796335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4148  Holliday junction resolvase YqgF  43.61 
 
 		 158 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2514  Holliday junction resolvase-like protein  41.04 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.36708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1969  Holliday junction resolvase-like protein  37.12 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0212683 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1942  Holliday junction resolvase-like protein  37.12 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1130  Holliday junction resolvase YqgF  34.59 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3810  Holliday junction resolvase-like protein  31.34 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2429  Holliday junction resolvase YqgF  33.08 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1858  Holliday junction resolvase-like protein  30.37 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2326  Holliday junction resolvase-like protein  30.43 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1996  Holliday junction resolvase-like protein  30.37 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3169  Holliday junction resolvase-like protein  30.37 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2747  Holliday junction resolvase-like protein  30.37 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3147  Holliday junction resolvase-like protein  30.37 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0917  Holliday junction resolvase-like protein  30.37 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0869  Holliday junction resolvase-like protein  31.34 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3713  Holliday junction resolvase YqgF  34.59 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0658941  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3111  Holliday junction resolvase-like protein  30.37 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2535  Holliday junction resolvase-like protein  36.43 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52249 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0925  Holliday junction resolvase YqgF  40 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1879  Holliday junction resolvase-like protein  33.08 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3225  Holliday junction resolvase YqgF  32.12 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1829  Holliday junction resolvase YqgF  34.56 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0551936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0014  Holliday junction resolvase YqgF  36.5 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1640  Holliday junction resolvase YqgF  35.34 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.278901  normal  0.163549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1463  Holliday junction resolvase-like protein  31.65 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0775  Holliday junction resolvase YqgF  32.09 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000463594  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2684  Holliday junction resolvase-like protein  33.08 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2407  Holliday junction resolvase YqgF  34.11 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.664688  normal  0.90932 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0423  Holliday junction resolvase-like protein  29.1 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1342  Holliday junction resolvase-like protein  33.08 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00888056  normal  0.184568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0244  Holliday junction resolvase-like protein  32.39 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.535412  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0906  Holliday junction resolvase-like protein  35.16 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167999  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0470  Holliday junction resolvase YqgF  32.82 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000599692  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1191  Holliday junction resolvase YqgF  32.84 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000237997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0367  Holliday junction resolvase YqgF  30 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1820  Holliday junction resolvase YqgF  33.82 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610168 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2024  Holliday junction resolvase YqgF  34.35 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330713  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07810  conserved hypothetical protein TIGR00250  35.56 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0182311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3892  Holliday junction resolvase-like protein  27.78 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2523  Holliday junction resolvase-like protein  31.51 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159244 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0510  Holliday junction resolvase-like protein  33.08 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.556579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0967  Holliday junction resolvase-like protein  30.08 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0836  Holliday junction resolvase-like protein  32.86 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  hitchhiker  0.00221177 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2739  Holliday junction resolvase YqgF  33.33 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0383  Holliday junction resolvase-like protein  32.86 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0865  Holliday junction resolvase-like protein  32.86 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2570  Holliday junction resolvase YqgF  30.08 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00347975  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1768  Holliday junction resolvase-like protein  30.65 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3963  Holliday junction resolvase-like protein  32.86 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1708  Holliday junction resolvase YqgF  32.37 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.180151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0094  Holliday junction resolvase YqgF  32.82 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0018567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0755  Holliday junction resolvase-like protein  32.86 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.302865  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3877  Holliday junction resolvase YqgF  32.59 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0738  Holliday junction resolvase-like protein  32.86 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05280  Holliday junction resolvase-like protein  34.81 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0504  Holliday junction resolvase-like protein  35.07 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3074  Holliday junction resolvase YqgF  32.85 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0265  Holliday junction resolvase-like protein  29.32 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0706  Holliday junction resolvase-like protein  28.15 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05800  Holliday junction resolvase YqgF  30.53 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.209228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3157  Holliday junction resolvase YqgF  32.31 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.588989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0074  Holliday junction resolvase YqgF  29.41 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.974882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2742  Holliday junction resolvase-like protein  29.37 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0556  Holliday junction resolvase YqgF  31.3 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.901255  normal  0.0480752 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0138  Holliday junction resolvase-like protein  29.93 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4344  Holliday junction resolvase YqgF  36.72 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.892789  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3035  Holliday junction resolvase YqgF  35.94 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101605  normal  0.0662243 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0621  Holliday junction resolvase-like protein  30.53 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3178  Holliday junction resolvase YqgF  31.21 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.825708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0088  Holliday junction resolvase YqgF  28.57 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1361  Holliday junction resolvase YqgF  35.2 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3922  Holliday junction resolvase YqgF  37.4 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0475  Holliday junction resolvase YqgF  35.66 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437798  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5038  hypothetical protein  32.12 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1285  Holliday junction resolvase YqgF  26.32 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0394867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0102  Holliday junction resolvase YqgF  30.77 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2911  Holliday junction resolvase YqgF  33.58 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0484  Holliday junction resolvase-like protein  32.12 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0568  Holliday junction resolvase-like protein  27.86 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0314  Holliday junction resolvase YqgF  31.82 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0417  Holliday junction resolvase YqgF  28.36 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1232  Holliday junction resolvase-like protein  33.85 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0873  Holliday junction resolvase YqgF  33.59 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0928843  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4721  Holliday junction resolvase-like protein  31.82 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0540  Holliday junction resolvase YqgF  27.82 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5401  Holliday junction resolvase YqgF  36.84 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  0.68966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>