259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_09701 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_09701  endonuclease  100 
 
 		 145 aa  296  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.23747  hitchhiker  0.00428266 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0783  Holliday junction resolvase YqgF  60.45 
 
 		 164 aa  167  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08311  endonuclease  58.96 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0380749  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0199  Holliday junction resolvase YqgF  58.21 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102311  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17391  endonuclease  57.78 
 
 		 214 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08551  endonuclease  49.63 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08521  endonuclease  49.63 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.329669  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0799  Holliday junction resolvase YqgF  50.36 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07901  endonuclease  48.53 
 
 		 151 aa  139  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1870  Holliday junction resolvase YqgF  59.7 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.950837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3098  Holliday junction resolvase-like protein  38.3 
 
 		 151 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2398  Holliday junction resolvase-like protein  38.69 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0366153  hitchhiker  0.00151496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3804  Holliday junction resolvase-like protein  35.11 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0796335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4148  Holliday junction resolvase YqgF  35.11 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4379  Holliday junction resolvase-like protein  36.76 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.556882  normal  0.251804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1942  Holliday junction resolvase-like protein  37.4 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1969  Holliday junction resolvase-like protein  37.4 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0212683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2514  Holliday junction resolvase-like protein  36.84 
 
 		 150 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.36708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0088  Holliday junction resolvase YqgF  31.85 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0423  Holliday junction resolvase-like protein  32.59 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0556  Holliday junction resolvase YqgF  29.63 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.901255  normal  0.0480752 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0906  Holliday junction resolvase-like protein  34.88 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167999  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07810  conserved hypothetical protein TIGR00250  32.31 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0182311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3922  Holliday junction resolvase YqgF  33.33 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2162  Holliday junction resolvase YqgF  32.12 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0967  Holliday junction resolvase-like protein  31.16 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1064  Holliday junction resolvase-like protein  32.37 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1708  Holliday junction resolvase YqgF  30.71 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.180151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0775  Holliday junction resolvase YqgF  30.15 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000463594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2024  Holliday junction resolvase YqgF  28.87 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330713  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1879  Holliday junction resolvase-like protein  32.09 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3713  Holliday junction resolvase YqgF  30.08 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0658941  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1130  Holliday junction resolvase YqgF  27.07 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1165  RNase H-like ribonuclease  30.83 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1996  Holliday junction resolvase-like protein  26.24 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3169  Holliday junction resolvase-like protein  26.24 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0917  Holliday junction resolvase-like protein  26.24 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2747  Holliday junction resolvase-like protein  26.24 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3147  Holliday junction resolvase-like protein  26.24 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1858  Holliday junction resolvase-like protein  26.24 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3111  Holliday junction resolvase-like protein  26.24 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3810  Holliday junction resolvase-like protein  25.2 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2535  Holliday junction resolvase-like protein  28.68 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52249 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1191  Holliday junction resolvase YqgF  30 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000237997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05800  Holliday junction resolvase YqgF  31.3 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.209228  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0014  Holliday junction resolvase YqgF  27.01 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1640  Holliday junction resolvase YqgF  29.77 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.278901  normal  0.163549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1463  Holliday junction resolvase-like protein  26.24 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2326  Holliday junction resolvase-like protein  25.93 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3225  Holliday junction resolvase YqgF  29.41 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0367  Holliday junction resolvase YqgF  29.93 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2684  Holliday junction resolvase-like protein  30.3 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0869  Holliday junction resolvase-like protein  26.87 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1938  Holliday junction resolvase-like protein  31.62 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000471473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3877  Holliday junction resolvase YqgF  28.89 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2406  Holliday junction resolvase YqgF  27.41 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.406379  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1342  Holliday junction resolvase-like protein  30.3 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00888056  normal  0.184568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2321  Holliday junction resolvase YqgF  31.3 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0094  Holliday junction resolvase YqgF  28.03 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0018567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3023  Holliday junction resolvase-like protein  31.06 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.394583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0470  Holliday junction resolvase YqgF  28.36 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000599692  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2739  Holliday junction resolvase YqgF  30.6 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0601  Holliday junction resolvase YqgF  33.6 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0474  Holliday junction resolvase YqgF  31.06 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00800439  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2429  Holliday junction resolvase-like protein  31.82 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0446184 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3633  Holliday junction resolvase YqgF  25.19 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2429  Holliday junction resolvase YqgF  29.2 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1361  Holliday junction resolvase YqgF  30.66 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0475  Holliday junction resolvase YqgF  34.85 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437798  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0244  Holliday junction resolvase-like protein  27.74 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.535412  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2090  Holliday junction resolvase-like protein  30.3 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000724166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2633  Holliday junction resolvase-like protein  25.58 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1024  Holliday junction resolvase YqgF  30.53 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2015  Holliday junction resolvase YqgF  28.24 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.756916  normal  0.07881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4721  Holliday junction resolvase-like protein  29.55 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2570  Holliday junction resolvase YqgF  27.21 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00347975  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0510  Holliday junction resolvase-like protein  30.3 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.556579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0838  hypothetical protein  32.84 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.115372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0676  Holliday junction resolvase-like protein  26.36 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0458  Holliday junction resolvase YqgF  28.46 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3892  Holliday junction resolvase-like protein  25.74 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1360  Holliday junction resolvase-like protein  29.41 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0138  Holliday junction resolvase-like protein  30.43 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2407  Holliday junction resolvase YqgF  30 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.664688  normal  0.90932 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2727  Holliday junction resolvase-like protein  25.58 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1232  Holliday junction resolvase-like protein  25.58 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2181  Holliday junction resolvase YqgF  30.15 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4344  Holliday junction resolvase YqgF  33.08 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.892789  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0620  Holliday junction resolvase-like protein  25.76 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3035  Holliday junction resolvase YqgF  30.23 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101605  normal  0.0662243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0568  Holliday junction resolvase-like protein  28.57 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3314  Holliday junction resolvase YqgF  34.35 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1438  Holliday junction resolvase YqgF  31.3 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3178  Holliday junction resolvase YqgF  30.08 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.825708  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0873  Holliday junction resolvase YqgF  29.23 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0928843  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0938  Holliday junction resolvase YqgF  25.19 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2004  Holliday junction resolvase-like protein  29.9 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166059  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0925  Holliday junction resolvase YqgF  32 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6093  endonuclease involved in recombination-like protein  30.53 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0746227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2279  Holliday junction resolvase-like protein  28.87 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>