More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3650 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3650  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 517 aa  1073    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826271 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2103  methionyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 550 aa  432  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.970175 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 648 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 657 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 642 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 642 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0724  methionyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 670 aa  419  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 663 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 636 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 628 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 640 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 648 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 651 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 670 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 647 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 533 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 628 aa  388  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 650 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 511 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 509 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 638 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 653 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 508 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 654 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 509 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 509 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 530 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 647 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 516 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 519 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1000  methionyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 645 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 645 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 516 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 632 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 624 aa  367  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 645 aa  368  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 645 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 525 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 539 aa  365  1e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 515 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 516 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 655 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 634 aa  363  4e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 671 aa  363  5.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 520 aa  362  6e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 516 aa  362  9e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 648 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 650 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 515 aa  360  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 515 aa  360  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 523 aa  359  6e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 653 aa  359  6e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 522 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 518 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0807  methionyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 530 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 541 aa  356  5.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 546 aa  355  7.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 514 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 550 aa  355  7.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1939  methionyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 521 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 660 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0529  methionyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 503 aa  354  2e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0742332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 659 aa  353  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0352  methionyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 545 aa  353  4e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 660 aa  353  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 660 aa  353  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 660 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 660 aa  353  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0541  methionyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 519 aa  353  5e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 660 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 660 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 642 aa  351  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 660 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 675 aa  350  4e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 660 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 660 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 544 aa  349  7e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4803  methionyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 511 aa  349  7e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  42.26 
 
 		 574 aa  348  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 666 aa  348  1e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 650 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 657 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5259  methionyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 501 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4645  methionyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 515 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.975298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4266  methionyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 515 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4352  methionyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 515 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 657 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 648 aa  347  3e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 517 aa  347  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 535 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 535 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>