More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28993 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC00220  CTP synthase, putative  58.17 
 
 
625 aa  655    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78143  CTP synthase  58.93 
 
 
573 aa  669    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28993  CTP synthase  100 
 
 
587 aa  1219    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50034  predicted protein  57.07 
 
 
547 aa  629  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0110404  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00490  CTP synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05210)  55.34 
 
 
583 aa  624  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.339989  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  50.64 
 
 
534 aa  579  1e-164  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  51.38 
 
 
533 aa  555  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  51.01 
 
 
533 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  51.01 
 
 
533 aa  555  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  50.45 
 
 
534 aa  548  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  50.55 
 
 
541 aa  542  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  49.36 
 
 
534 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3518  CTP synthetase  52.21 
 
 
534 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0204135  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  49.55 
 
 
551 aa  530  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  48.27 
 
 
542 aa  530  1e-149  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  49.91 
 
 
546 aa  530  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  46.93 
 
 
545 aa  526  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  49.73 
 
 
550 aa  526  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  49.08 
 
 
542 aa  524  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  49.36 
 
 
530 aa  523  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  49.1 
 
 
568 aa  522  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  49.37 
 
 
552 aa  523  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  49.08 
 
 
535 aa  525  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  49.08 
 
 
535 aa  525  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  48.16 
 
 
535 aa  521  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  46.93 
 
 
543 aa  519  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  47.11 
 
 
543 aa  521  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  49.09 
 
 
540 aa  519  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  49.45 
 
 
562 aa  519  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  47.11 
 
 
543 aa  521  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  46.53 
 
 
535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  47.44 
 
 
535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  47.44 
 
 
535 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  47.44 
 
 
535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  47.36 
 
 
531 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  48.44 
 
 
533 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  47.44 
 
 
535 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  47.44 
 
 
535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  47.54 
 
 
537 aa  517  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  48.55 
 
 
608 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  47.44 
 
 
535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  48 
 
 
538 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0908  CTP synthetase  46.82 
 
 
544 aa  513  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  47.72 
 
 
535 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  47.25 
 
 
535 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  47.43 
 
 
532 aa  515  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  47.25 
 
 
535 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  46.2 
 
 
536 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  47.43 
 
 
531 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  46.42 
 
 
542 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  47.44 
 
 
535 aa  514  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  47.25 
 
 
535 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  48.72 
 
 
534 aa  511  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  46.53 
 
 
555 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  48.16 
 
 
534 aa  509  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  46.93 
 
 
546 aa  509  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  49.09 
 
 
558 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  45.89 
 
 
546 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  45.5 
 
 
555 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  47.71 
 
 
536 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  47.8 
 
 
546 aa  508  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  48.17 
 
 
534 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  46.34 
 
 
547 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  46.7 
 
 
558 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  45.5 
 
 
555 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  46.15 
 
 
547 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  47.04 
 
 
547 aa  508  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2084  CTP synthetase  46.39 
 
 
544 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0736609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2349  CTP synthetase  47.48 
 
 
567 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00181138  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  47.08 
 
 
534 aa  505  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  45.65 
 
 
536 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  45.83 
 
 
536 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  48.18 
 
 
555 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  48.18 
 
 
555 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  46.17 
 
 
536 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  48.36 
 
 
555 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  48.18 
 
 
572 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  45.55 
 
 
540 aa  502  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  46.63 
 
 
555 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  47.8 
 
 
652 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  47.56 
 
 
560 aa  503  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  45.13 
 
 
555 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  45.52 
 
 
545 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  46.07 
 
 
543 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  49.1 
 
 
553 aa  501  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  47.32 
 
 
551 aa  501  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  45.63 
 
 
542 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  45.63 
 
 
542 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  47.34 
 
 
533 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  44.98 
 
 
547 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  45.77 
 
 
558 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  45.78 
 
 
558 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  46.1 
 
 
543 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  46.9 
 
 
549 aa  498  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  44.5 
 
 
533 aa  496  1e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  47.62 
 
 
537 aa  496  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  44.77 
 
 
555 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  45.59 
 
 
533 aa  497  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  47.09 
 
 
555 aa  495  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0382  CTP synthase  47.09 
 
 
560 aa  498  1e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>