More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0382 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1911  CTP synthetase  68.93 
 
 
581 aa  750    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115982  hitchhiker  0.000439643 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12400  CTP synthetase  69.02 
 
 
553 aa  749    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023708  normal  0.233507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13730  CTP synthetase  68.14 
 
 
624 aa  773    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5411  CTP synthetase  69.37 
 
 
565 aa  759    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  70.19 
 
 
546 aa  810    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1920  CTP synthetase  68.57 
 
 
581 aa  749    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.270417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  69.98 
 
 
572 aa  807    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  68.19 
 
 
581 aa  786    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  68.8 
 
 
566 aa  768    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2959  CTP synthetase  69.3 
 
 
579 aa  774    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14180  CTP synthetase  68.67 
 
 
563 aa  777    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.609851  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3001  CTP synthase  69.71 
 
 
566 aa  773    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427451  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2836  CTP synthase  68.63 
 
 
559 aa  766    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0206831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5435  CTP synthetase  67.52 
 
 
589 aa  747    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00181043  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  66.24 
 
 
608 aa  758    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0608  CTP synthetase  92.57 
 
 
553 aa  1069    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.235124  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0382  CTP synthase  100 
 
 
560 aa  1158    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2377  CTP synthase  70.13 
 
 
581 aa  741    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  69.33 
 
 
558 aa  764    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2944  CTP synthetase  69.3 
 
 
579 aa  774    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3502  CTP synthetase  67.16 
 
 
585 aa  735    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676775  normal  0.111203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  70.83 
 
 
554 aa  813    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11714  CTP synthetase  68.45 
 
 
586 aa  765    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.24232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4064  CTP synthetase  70.09 
 
 
583 aa  783    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.541211  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2823  CTP synthase  67.77 
 
 
578 aa  748    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2990  CTP synthase  67.59 
 
 
563 aa  759    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781575  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2349  CTP synthetase  71 
 
 
567 aa  791    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00181138  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  58.3 
 
 
535 aa  638    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  73.2 
 
 
560 aa  826    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1519  CTP synthetase  70.3 
 
 
597 aa  805    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  71.01 
 
 
558 aa  823    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1518  CTP synthetase  69.47 
 
 
587 aa  796    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000885327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1243  CTP synthetase  70.2 
 
 
558 aa  762    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0811753  normal  0.94922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4432  CTP synthase  63.02 
 
 
587 aa  739    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281255  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  70.02 
 
 
569 aa  804    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1664  CTP synthase  70.82 
 
 
553 aa  782    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.210101  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2988  CTP synthetase  69.3 
 
 
579 aa  774    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3283  CTP synthetase  68.93 
 
 
583 aa  765    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  66.48 
 
 
652 aa  749    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  58.23 
 
 
535 aa  632  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  56.67 
 
 
533 aa  624  1e-177  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  56.11 
 
 
542 aa  623  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  55.93 
 
 
533 aa  620  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  56.11 
 
 
533 aa  620  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  56.88 
 
 
551 aa  616  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  56.32 
 
 
535 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  56.32 
 
 
535 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  56.67 
 
 
533 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  54.93 
 
 
531 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  56.61 
 
 
533 aa  609  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  57.49 
 
 
540 aa  610  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  55.29 
 
 
532 aa  609  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  56.13 
 
 
536 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  55.76 
 
 
532 aa  608  9.999999999999999e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  55.2 
 
 
547 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  55.02 
 
 
547 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  54.8 
 
 
541 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  54.09 
 
 
531 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  56.53 
 
 
547 aa  605  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  53.05 
 
 
536 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  54.74 
 
 
545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  53.05 
 
 
536 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  54.8 
 
 
538 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  54.44 
 
 
534 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  54.36 
 
 
535 aa  600  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  55.39 
 
 
555 aa  596  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  55.22 
 
 
545 aa  597  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  54.19 
 
 
534 aa  596  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  55.33 
 
 
555 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  52.42 
 
 
533 aa  597  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  54.09 
 
 
534 aa  592  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  52.68 
 
 
535 aa  593  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  55.6 
 
 
557 aa  594  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  56.51 
 
 
549 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  53.49 
 
 
545 aa  591  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  52.85 
 
 
542 aa  593  1e-168  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  53.6 
 
 
537 aa  592  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  53.35 
 
 
534 aa  591  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  54.21 
 
 
555 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  55.15 
 
 
549 aa  594  1e-168  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  53.42 
 
 
535 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  54.77 
 
 
555 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  53.42 
 
 
535 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  55.05 
 
 
546 aa  588  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  52.93 
 
 
558 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  52.76 
 
 
558 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  55.41 
 
 
554 aa  591  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  55.33 
 
 
533 aa  590  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  53.23 
 
 
535 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  53.42 
 
 
535 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  53.05 
 
 
535 aa  585  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  53.23 
 
 
535 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  54.58 
 
 
555 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  53.89 
 
 
534 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  54.48 
 
 
546 aa  585  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  54.26 
 
 
555 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  53.23 
 
 
535 aa  587  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  55.12 
 
 
547 aa  586  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  54.44 
 
 
555 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  54.68 
 
 
559 aa  585  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>