More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78143 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00490  CTP synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05210)  62.17 
 
 		 583 aa  734    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.339989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00220  CTP synthase, putative  62.2 
 
 		 625 aa  770    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78143  CTP synthase  100 
 
 		 573 aa  1183    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28993  CTP synthase  59.11 
 
 		 587 aa  626  1e-178  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50034  predicted protein  55.99 
 
 		 547 aa  607  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0110404  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  50 
 
 		 534 aa  527  1e-148  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  48.02 
 
 		 534 aa  518  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  48.51 
 
 		 550 aa  519  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  48.04 
 
 		 551 aa  514  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  47.84 
 
 		 562 aa  502  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  47.84 
 
 		 568 aa  501  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3518  CTP synthetase  49.19 
 
 		 534 aa  498  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0204135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  47.86 
 
 		 546 aa  498  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  47.12 
 
 		 552 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  47.37 
 
 		 542 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  46.89 
 
 		 533 aa  485  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  47.31 
 
 		 533 aa  485  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  47.14 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  46.87 
 
 		 533 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1134  CTP synthetase  47.84 
 
 		 527 aa  480  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  46.14 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  46.3 
 
 		 534 aa  476  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  45.18 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  44.06 
 
 		 558 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  43.88 
 
 		 547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  44.31 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  43.13 
 
 		 547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  45.77 
 
 		 526 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  44.78 
 
 		 531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  44.27 
 
 		 546 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  45.54 
 
 		 531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  45.8 
 
 		 541 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  45.62 
 
 		 530 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  45.5 
 
 		 553 aa  467  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  45.08 
 
 		 535 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  45.08 
 
 		 535 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  43.71 
 
 		 535 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  43.96 
 
 		 534 aa  462  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  43.88 
 
 		 545 aa  465  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  44.54 
 
 		 534 aa  464  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  43.62 
 
 		 537 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  44.78 
 
 		 531 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  44.27 
 
 		 542 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  43.82 
 
 		 546 aa  463  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1899  CTP synthetase  45.77 
 
 		 529 aa  464  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  43.71 
 
 		 535 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  43.53 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  43.71 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  43.69 
 
 		 555 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  43.71 
 
 		 535 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  45.6 
 
 		 533 aa  459  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  43.29 
 
 		 536 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  45.16 
 
 		 534 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  43.71 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  43.71 
 
 		 535 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  44.05 
 
 		 555 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  43.71 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  43.29 
 
 		 536 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  43.99 
 
 		 532 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  43.32 
 
 		 533 aa  455  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  43.53 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  43.53 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  43.64 
 
 		 552 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  43.53 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  43.4 
 
 		 534 aa  457  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  45.06 
 
 		 534 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  45.7 
 
 		 557 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  43.44 
 
 		 540 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  43.09 
 
 		 545 aa  458  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  42.63 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  42.11 
 
 		 533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3111  CTP synthetase  43.54 
 
 		 545 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  44.56 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  42.05 
 
 		 542 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3169  CTP synthetase  43.62 
 
 		 545 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659472  normal  0.252968 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03082  CTP synthetase  43.13 
 
 		 543 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000772842  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3267  CTP synthetase  43.62 
 
 		 545 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0428959 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0133  CTP synthetase  43.14 
 
 		 532 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  44.48 
 
 		 555 aa  455  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  45.7 
 
 		 555 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  44 
 
 		 552 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  44.54 
 
 		 558 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  42.23 
 
 		 543 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  44.04 
 
 		 543 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2084  CTP synthetase  43.74 
 
 		 544 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0736609  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  44.85 
 
 		 536 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  44.36 
 
 		 547 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  43.88 
 
 		 533 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  42.48 
 
 		 545 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3150  CTP synthetase  43.62 
 
 		 545 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858121  normal  0.288938 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  44.91 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3443  CTP synthetase  44.36 
 
 		 559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  43.71 
 
 		 536 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3086  CTP synthetase  43.62 
 
 		 545 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  43.64 
 
 		 566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  43.88 
 
 		 555 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  41.87 
 
 		 542 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  43.71 
 
 		 555 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  41.87 
 
 		 542 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  41.87 
 
 		 542 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>