108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0598 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0598  VanW family protein  100 
 
 
268 aa  556  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000119238  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2239  vancomycin B-type resistance protein VanW  62.55 
 
 
276 aa  342  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00319629  hitchhiker  0.00000191747 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3002  vancomycin B-type resistance protein VanW  62.55 
 
 
276 aa  341  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5507  VanW family protein  58.96 
 
 
277 aa  333  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.170032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1773  VanW family protein  55.47 
 
 
301 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11841  hypothetical protein  46.01 
 
 
270 aa  254  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_002950  PG0532  hypothetical protein  50.19 
 
 
299 aa  246  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2034  VanW  40.5 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54600  hypothetical protein  41.01 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0220314  normal  0.0306544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4771  hypothetical protein  40.55 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1663  VanW family protein  30.74 
 
 
276 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  35.11 
 
 
510 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  30.64 
 
 
481 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  29.09 
 
 
520 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  35.04 
 
 
569 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  34.78 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  32.74 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  30.56 
 
 
491 aa  79.3  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  32.28 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  35.09 
 
 
503 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  38.37 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  32.37 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  32.31 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  35.04 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  34.78 
 
 
491 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  32.74 
 
 
453 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  33.83 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  38.26 
 
 
518 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  39.6 
 
 
520 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  35.38 
 
 
591 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  33.83 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  33.83 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  33.83 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  33.83 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  33.83 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  33.83 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  33.83 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  33.83 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  33.83 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  33.82 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  30.89 
 
 
600 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  36.04 
 
 
458 aa  73.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  30.53 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  33.33 
 
 
781 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  33.12 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  29.01 
 
 
686 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  29.91 
 
 
456 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  29.41 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  33.72 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  31.15 
 
 
642 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  28.95 
 
 
594 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  34.65 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  33.73 
 
 
633 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  33.73 
 
 
565 aa  66.2  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  33.06 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  33.04 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  31.93 
 
 
677 aa  65.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  34.51 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  30.17 
 
 
393 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  30.89 
 
 
219 aa  63.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  29.41 
 
 
636 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  31.09 
 
 
670 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  33.33 
 
 
682 aa  62.4  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  32.17 
 
 
420 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  29.41 
 
 
675 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  32.17 
 
 
420 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  32.17 
 
 
420 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  32.17 
 
 
420 aa  62  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  32.17 
 
 
420 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  32.17 
 
 
420 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  28.57 
 
 
420 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  32.17 
 
 
420 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  27.73 
 
 
636 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  28.57 
 
 
420 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  28.57 
 
 
420 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  29.36 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  25.15 
 
 
576 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  33.33 
 
 
417 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  27.52 
 
 
489 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  28.1 
 
 
765 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  33.66 
 
 
591 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  28.46 
 
 
580 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  24.31 
 
 
580 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0832  VanW family protein  28.26 
 
 
368 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  30.89 
 
 
847 aa  59.7  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  28.21 
 
 
582 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  29.41 
 
 
579 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  30.59 
 
 
450 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  33.75 
 
 
550 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  32.71 
 
 
748 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  36.25 
 
 
604 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  30.87 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  33.33 
 
 
569 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  32.26 
 
 
608 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  25.49 
 
 
892 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  24.31 
 
 
567 aa  52.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  29.27 
 
 
455 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  28.44 
 
 
337 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  28.57 
 
 
420 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  27.78 
 
 
420 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>