117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1933 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  100 
 
 
633 aa  1263    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  51.73 
 
 
636 aa  609  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  51.81 
 
 
636 aa  598  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  44.52 
 
 
677 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  43.76 
 
 
670 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  43.52 
 
 
675 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  39.19 
 
 
686 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  44.09 
 
 
594 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1425  VanW family protein  29.91 
 
 
617 aa  254  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  33.91 
 
 
781 aa  248  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  29.7 
 
 
591 aa  232  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  31.86 
 
 
565 aa  211  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  30.23 
 
 
579 aa  190  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  41.67 
 
 
403 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  38.46 
 
 
480 aa  178  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  37.3 
 
 
393 aa  177  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  38.32 
 
 
450 aa  173  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  23.54 
 
 
569 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  27.46 
 
 
580 aa  140  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  25.89 
 
 
591 aa  140  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  27.79 
 
 
491 aa  140  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  33.66 
 
 
1016 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  26.76 
 
 
582 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  27.06 
 
 
642 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  26.68 
 
 
776 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  28.05 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  27.2 
 
 
580 aa  127  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  25.57 
 
 
550 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  30.47 
 
 
436 aa  125  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  29.37 
 
 
474 aa  125  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  31.65 
 
 
435 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  24.7 
 
 
690 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  26.6 
 
 
567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  28.57 
 
 
604 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  24.37 
 
 
765 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  27.16 
 
 
748 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  26.7 
 
 
608 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  31.23 
 
 
620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  26.64 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  23.9 
 
 
847 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  30.99 
 
 
467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  22.58 
 
 
682 aa  115  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  28.7 
 
 
503 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  24.2 
 
 
576 aa  109  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  25.62 
 
 
633 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  27.34 
 
 
559 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  30.7 
 
 
518 aa  107  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  23.41 
 
 
569 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  29.28 
 
 
491 aa  104  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  27.66 
 
 
420 aa  103  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  28.09 
 
 
420 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  29.1 
 
 
772 aa  102  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  27.66 
 
 
420 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  27.66 
 
 
420 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  27.07 
 
 
417 aa  100  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  27.66 
 
 
420 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  27.66 
 
 
420 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  27.66 
 
 
420 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  27.66 
 
 
420 aa  100  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  26.67 
 
 
420 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  25.53 
 
 
439 aa  99.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  21.94 
 
 
892 aa  98.2  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  30.1 
 
 
420 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  30.1 
 
 
420 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  31.86 
 
 
303 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  26.27 
 
 
420 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  33.18 
 
 
303 aa  96.3  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  31.86 
 
 
303 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  25.89 
 
 
510 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  39.23 
 
 
219 aa  95.5  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  28.88 
 
 
456 aa  95.5  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  33.33 
 
 
303 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  33.33 
 
 
303 aa  94.7  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  33.33 
 
 
303 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  33.33 
 
 
303 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  28.05 
 
 
481 aa  94.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  29.44 
 
 
453 aa  94.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  32.8 
 
 
303 aa  94  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  33.33 
 
 
303 aa  94  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  33.33 
 
 
303 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  29.06 
 
 
373 aa  93.6  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  36.77 
 
 
600 aa  92.8  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  41.53 
 
 
366 aa  90.5  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  26.58 
 
 
314 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  28.07 
 
 
520 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  28.96 
 
 
304 aa  88.2  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  29.52 
 
 
319 aa  87.4  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2825  putative vancomycin resistance protein  26.08 
 
 
652 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  25 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  25.86 
 
 
455 aa  84  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  32.06 
 
 
738 aa  83.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  28.51 
 
 
279 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  39.04 
 
 
296 aa  80.5  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.46 
 
 
866 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0758  VanW family protein  23.26 
 
 
1355 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.115824 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  31.62 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1663  VanW family protein  32.31 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54600  hypothetical protein  38.33 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0220314  normal  0.0306544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4771  hypothetical protein  38.33 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  26.81 
 
 
248 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>