112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2734 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2734  VanW  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  41.83 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  36.33 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  37.22 
 
 		 439 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  38.36 
 
 		 491 aa  148  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  37.45 
 
 		 491 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  36.4 
 
 		 474 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  38.35 
 
 		 435 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  34.75 
 
 		 453 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  36.4 
 
 		 510 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  47.01 
 
 		 600 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  36.6 
 
 		 481 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  36.12 
 
 		 436 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  36.76 
 
 		 458 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  35.83 
 
 		 456 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  34.84 
 
 		 503 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  34.03 
 
 		 467 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  44.9 
 
 		 520 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  36.28 
 
 		 520 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  40.86 
 
 		 518 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  34.48 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  44.85 
 
 		 366 aa  123  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  37.5 
 
 		 781 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  33.33 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  38.6 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  38.6 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  38.6 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  38.6 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  38.6 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  38.6 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  38.01 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  41.1 
 
 		 253 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  38.01 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  34.6 
 
 		 420 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  32.9 
 
 		 569 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  31.69 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  40.94 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  34.3 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  35.86 
 
 		 580 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  34.15 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  34.15 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  34.15 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  34.15 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  34.15 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  38.56 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  34.15 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  33.66 
 
 		 420 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  37.5 
 
 		 420 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  33.66 
 
 		 420 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  33.17 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  32.07 
 
 		 620 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  35.81 
 
 		 569 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  30.11 
 
 		 608 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  39.1 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  33.82 
 
 		 576 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  33.03 
 
 		 417 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  31.15 
 
 		 591 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  31.87 
 
 		 636 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  32.56 
 
 		 393 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  32 
 
 		 636 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  28.87 
 
 		 591 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  33.98 
 
 		 686 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  30.2 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  36.77 
 
 		 738 aa  99.8  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  33.56 
 
 		 319 aa  99.4  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0964  hypothetical protein  37.5 
 
 		 419 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  31.86 
 
 		 690 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  39.53 
 
 		 489 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  31.9 
 
 		 677 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  31.13 
 
 		 559 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  35.71 
 
 		 765 aa  97.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  30.36 
 
 		 604 aa  95.9  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  34.93 
 
 		 319 aa  95.9  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  33.47 
 
 		 550 aa  95.5  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  28.29 
 
 		 403 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  32.84 
 
 		 776 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  31 
 
 		 582 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  32.5 
 
 		 594 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  41.73 
 
 		 642 aa  92  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  32.31 
 
 		 580 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0832  VanW family protein  35.04 
 
 		 368 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  27.91 
 
 		 633 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  32 
 
 		 675 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1425  VanW family protein  28.87 
 
 		 617 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  29.33 
 
 		 450 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  30.17 
 
 		 579 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  32.51 
 
 		 670 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  37.68 
 
 		 337 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  30.83 
 
 		 772 aa  85.9  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  32.24 
 
 		 748 aa  85.9  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  30.73 
 
 		 1016 aa  82.8  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  31.85 
 
 		 682 aa  82.4  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  35.11 
 
 		 633 aa  82.4  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  32.3 
 
 		 567 aa  79.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  36.62 
 
 		 565 aa  79.3  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  27.78 
 
 		 847 aa  78.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  28.02 
 
 		 480 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3002  vancomycin B-type resistance protein VanW  34.59 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4771  hypothetical protein  30.18 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>