112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0423 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  100 
 
 
314 aa  652    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  56.69 
 
 
319 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  47.54 
 
 
337 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  37.32 
 
 
458 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  37.5 
 
 
491 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  36.41 
 
 
435 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  33.33 
 
 
510 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  34.45 
 
 
491 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  32.69 
 
 
569 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  33.72 
 
 
436 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  37.93 
 
 
474 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  32.75 
 
 
453 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  39.22 
 
 
600 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  46.83 
 
 
366 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  33.17 
 
 
503 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  47.66 
 
 
456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  31.22 
 
 
439 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  36.04 
 
 
781 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  34.76 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  32.16 
 
 
467 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  38.71 
 
 
420 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  38.71 
 
 
420 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  38.06 
 
 
420 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  38.06 
 
 
420 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  38.06 
 
 
420 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  38.06 
 
 
420 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  38.06 
 
 
420 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  47.32 
 
 
305 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  29.86 
 
 
481 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  39.69 
 
 
296 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  38.06 
 
 
420 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  38.06 
 
 
420 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  38.78 
 
 
248 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  40.44 
 
 
420 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  40.8 
 
 
518 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  35.58 
 
 
417 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  35.58 
 
 
253 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  40 
 
 
520 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  39.68 
 
 
373 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  43.86 
 
 
219 aa  102  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  40.27 
 
 
279 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  33.33 
 
 
420 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  30.23 
 
 
686 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  32.68 
 
 
420 aa  99  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  34 
 
 
520 aa  99  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  40.14 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  40.14 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  30.81 
 
 
690 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  38.24 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  38.24 
 
 
303 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  36.02 
 
 
591 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  38.24 
 
 
303 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  38.24 
 
 
303 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  38.24 
 
 
303 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  38.24 
 
 
303 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  38.24 
 
 
303 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  38.24 
 
 
303 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  29.17 
 
 
594 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  36.6 
 
 
304 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  28.64 
 
 
738 aa  94  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  30.48 
 
 
393 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  39.83 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  31.78 
 
 
580 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  27.36 
 
 
450 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  28.99 
 
 
489 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  26.58 
 
 
633 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  27.65 
 
 
670 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  28.11 
 
 
675 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  27.72 
 
 
480 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  31.78 
 
 
620 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  31.55 
 
 
455 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  33.61 
 
 
642 aa  85.5  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  28.33 
 
 
677 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  33.85 
 
 
748 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  36.52 
 
 
580 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  27.19 
 
 
576 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  30.63 
 
 
569 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  30.73 
 
 
559 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  34.68 
 
 
636 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  34.27 
 
 
636 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  26.67 
 
 
582 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  40.35 
 
 
591 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  30.05 
 
 
567 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0964  hypothetical protein  31.82 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0832  VanW family protein  31.82 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  29.17 
 
 
604 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3002  vancomycin B-type resistance protein VanW  30.34 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2239  vancomycin B-type resistance protein VanW  33.33 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00319629  hitchhiker  0.00000191747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  29.32 
 
 
765 aa  73.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  30.73 
 
 
565 aa  73.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  30.23 
 
 
579 aa  72.4  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  32.56 
 
 
608 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  29.5 
 
 
776 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1663  VanW family protein  35.04 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1773  VanW family protein  31.75 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0598  VanW family protein  29.41 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000119238  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5507  VanW family protein  26.79 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.170032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0758  VanW family protein  31.21 
 
 
1355 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.115824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  28.57 
 
 
1016 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  30 
 
 
682 aa  66.2  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>