119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2379 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  85.58 
 
 
670 aa  1132    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  100 
 
 
675 aa  1367    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  51.4 
 
 
677 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  43.27 
 
 
686 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  43.17 
 
 
633 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  43.2 
 
 
636 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  42.24 
 
 
636 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  41.19 
 
 
594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1425  VanW family protein  30.07 
 
 
617 aa  273  7e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  32.95 
 
 
781 aa  262  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  27.71 
 
 
591 aa  206  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  28.67 
 
 
565 aa  183  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  29.96 
 
 
642 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  26.37 
 
 
579 aa  161  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  34.04 
 
 
403 aa  157  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  25.4 
 
 
690 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  35.54 
 
 
450 aa  151  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  35.34 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  28.23 
 
 
776 aa  147  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  31.6 
 
 
480 aa  144  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  26.8 
 
 
1016 aa  143  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  28.74 
 
 
633 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  26.5 
 
 
591 aa  136  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  25.7 
 
 
580 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  33.22 
 
 
474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  27.43 
 
 
569 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  29.11 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  27.07 
 
 
772 aa  128  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  31.86 
 
 
580 aa  127  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  27.32 
 
 
582 aa  126  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  27.01 
 
 
491 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  26.68 
 
 
748 aa  126  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  29.39 
 
 
420 aa  124  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  29.01 
 
 
420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  26.72 
 
 
576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  29.01 
 
 
420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  29.01 
 
 
420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  30.69 
 
 
569 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  25.32 
 
 
491 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  26.89 
 
 
765 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  28.63 
 
 
420 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  28.63 
 
 
420 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  28.63 
 
 
420 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  28.63 
 
 
420 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  28.52 
 
 
420 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  28.44 
 
 
453 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  25.37 
 
 
892 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  28.14 
 
 
420 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  27.3 
 
 
520 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  28.24 
 
 
417 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  29.65 
 
 
518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  24.74 
 
 
550 aa  115  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  28.31 
 
 
436 aa  113  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  22.78 
 
 
847 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  27.04 
 
 
481 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  30.87 
 
 
373 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  29.21 
 
 
467 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  29.9 
 
 
604 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  30.48 
 
 
456 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  32.02 
 
 
608 aa  99.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  30.29 
 
 
620 aa  99  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  24.51 
 
 
435 aa  99  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  32.91 
 
 
567 aa  98.6  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  32.57 
 
 
559 aa  97.8  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  29.07 
 
 
503 aa  97.8  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  24.12 
 
 
439 aa  94  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  25.49 
 
 
510 aa  92.8  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  36.49 
 
 
600 aa  89.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  27.73 
 
 
314 aa  87.4  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  24.16 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  29.68 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  36.57 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  24.79 
 
 
420 aa  84  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  29.15 
 
 
303 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  29.15 
 
 
303 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  31.38 
 
 
303 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  31.38 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  31.38 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  31.38 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  31.91 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  32.07 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  31.38 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  31.08 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  29.58 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  29.52 
 
 
738 aa  81.3  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  25.2 
 
 
520 aa  78.2  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  36.75 
 
 
305 aa  76.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  26.77 
 
 
337 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  30.82 
 
 
304 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  41.12 
 
 
366 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  27.38 
 
 
682 aa  75.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  25.78 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0758  VanW family protein  25.36 
 
 
1355 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.115824 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  26.42 
 
 
296 aa  73.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  21.83 
 
 
866 aa  72.4  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  25.89 
 
 
455 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2825  putative vancomycin resistance protein  23.9 
 
 
652 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  24.38 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3002  vancomycin B-type resistance protein VanW  32.77 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  33.62 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>