118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1300 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  100 
 
 
491 aa  989    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  38.51 
 
 
458 aa  302  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  37.25 
 
 
520 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  37.19 
 
 
518 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  35.57 
 
 
481 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  31.14 
 
 
467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  31.91 
 
 
474 aa  222  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  32.02 
 
 
510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  30.87 
 
 
456 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  29.65 
 
 
436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  31.39 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  30.9 
 
 
491 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  34.2 
 
 
569 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  31.86 
 
 
439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  30.29 
 
 
503 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  30.46 
 
 
435 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  27.99 
 
 
420 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  27.77 
 
 
420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  42.42 
 
 
600 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  29.22 
 
 
520 aa  160  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  29.86 
 
 
420 aa  160  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  29.59 
 
 
420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  29.59 
 
 
420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  29.59 
 
 
420 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  28.71 
 
 
420 aa  156  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  29.32 
 
 
420 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  29.32 
 
 
420 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  29.32 
 
 
420 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  29.51 
 
 
420 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  28.53 
 
 
417 aa  154  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  27.25 
 
 
455 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  28.29 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  31.83 
 
 
781 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  27.79 
 
 
633 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  38.78 
 
 
373 aa  140  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  37.5 
 
 
314 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  38.17 
 
 
296 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  36.75 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  32.69 
 
 
608 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  36.45 
 
 
253 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  30.65 
 
 
620 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  34.04 
 
 
319 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  27.09 
 
 
636 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  31.4 
 
 
580 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  28.41 
 
 
636 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  29.11 
 
 
604 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  37.02 
 
 
279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  34.53 
 
 
594 aa  126  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  36.45 
 
 
219 aa  124  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  35.1 
 
 
337 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  30.92 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  27.6 
 
 
675 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  26.21 
 
 
686 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  27.67 
 
 
670 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  34.07 
 
 
248 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  31.09 
 
 
591 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  28.11 
 
 
580 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  40.48 
 
 
305 aa  114  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  27.16 
 
 
591 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  29.1 
 
 
582 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  28.05 
 
 
682 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  29.11 
 
 
748 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  37.65 
 
 
403 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  33.2 
 
 
550 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  26.32 
 
 
772 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  33.47 
 
 
303 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  33.47 
 
 
303 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  33.47 
 
 
303 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  33.47 
 
 
303 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  28.47 
 
 
576 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  32.5 
 
 
303 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  37.63 
 
 
366 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  33.47 
 
 
303 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  26.37 
 
 
690 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  32.73 
 
 
393 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  30.59 
 
 
567 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  30.25 
 
 
303 aa  107  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  30.25 
 
 
303 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  39.16 
 
 
303 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  39.16 
 
 
303 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  27.24 
 
 
565 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  27.17 
 
 
559 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  38.73 
 
 
304 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  29.36 
 
 
450 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  24.73 
 
 
579 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  27.4 
 
 
677 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  28.09 
 
 
1016 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  30.43 
 
 
892 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  39.84 
 
 
642 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  25.44 
 
 
765 aa  94  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1425  VanW family protein  24.25 
 
 
617 aa  92.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  30.77 
 
 
633 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  26.95 
 
 
738 aa  91.3  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  36.54 
 
 
776 aa  90.1  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3002  vancomycin B-type resistance protein VanW  35.88 
 
 
276 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  25.96 
 
 
480 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2239  vancomycin B-type resistance protein VanW  35.88 
 
 
276 aa  87  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00319629  hitchhiker  0.00000191747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  26.54 
 
 
847 aa  84.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5507  VanW family protein  34.35 
 
 
277 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.170032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  28.51 
 
 
569 aa  80.1  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>