101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0991 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  100 
 
 
1016 aa  1931    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  52.58 
 
 
776 aa  521  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  50.44 
 
 
765 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  46.15 
 
 
847 aa  482  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  49.19 
 
 
580 aa  437  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  46.85 
 
 
772 aa  433  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  38.55 
 
 
620 aa  294  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  34.64 
 
 
690 aa  291  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  35.88 
 
 
604 aa  291  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  35.22 
 
 
550 aa  280  7e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  35.96 
 
 
608 aa  279  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  32.23 
 
 
892 aa  271  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  35.16 
 
 
748 aa  264  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  35.19 
 
 
582 aa  257  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  35.38 
 
 
580 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  34.92 
 
 
576 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  32.59 
 
 
567 aa  223  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  33.21 
 
 
633 aa  218  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  33.71 
 
 
559 aa  211  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2825  putative vancomycin resistance protein  32.06 
 
 
652 aa  179  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0758  VanW family protein  31.06 
 
 
1355 aa  164  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.115824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  27.45 
 
 
682 aa  161  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  27.21 
 
 
686 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  28.15 
 
 
670 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  27.08 
 
 
675 aa  138  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  34.21 
 
 
633 aa  137  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  28.91 
 
 
636 aa  137  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  28.8 
 
 
636 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  30.98 
 
 
458 aa  126  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  27.13 
 
 
677 aa  123  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  31.41 
 
 
453 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  28.81 
 
 
569 aa  115  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  27.68 
 
 
594 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  30.31 
 
 
491 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  27.56 
 
 
781 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  27.42 
 
 
456 aa  109  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  27.02 
 
 
435 aa  105  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  32.33 
 
 
393 aa  105  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  28.98 
 
 
503 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1425  VanW family protein  24.66 
 
 
617 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  27.25 
 
 
510 aa  103  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  29.7 
 
 
436 aa  102  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  30.5 
 
 
565 aa  99  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  27.7 
 
 
489 aa  98.2  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  30.74 
 
 
738 aa  96.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  29.51 
 
 
474 aa  95.1  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  28.09 
 
 
491 aa  94.4  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  30.99 
 
 
569 aa  94  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  28.24 
 
 
591 aa  92.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  27.55 
 
 
467 aa  92.4  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  26 
 
 
420 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  26.69 
 
 
420 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  25.93 
 
 
420 aa  89.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  27.27 
 
 
420 aa  89.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  25.93 
 
 
420 aa  89.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  25.93 
 
 
420 aa  89  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  25.93 
 
 
420 aa  89  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  25.93 
 
 
420 aa  89  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  26.12 
 
 
420 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  27.17 
 
 
520 aa  86.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  31.98 
 
 
253 aa  87  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  36.36 
 
 
600 aa  85.9  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  26.94 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  32.92 
 
 
403 aa  83.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  26.36 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  33.11 
 
 
481 aa  82  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  28.46 
 
 
642 aa  82  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  31.22 
 
 
450 aa  80.1  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  27.92 
 
 
219 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38770  hypothetical protein  29.13 
 
 
415 aa  79  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  28.18 
 
 
439 aa  79  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  30.29 
 
 
579 aa  77  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  31.92 
 
 
248 aa  75.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  25.51 
 
 
520 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  30.24 
 
 
279 aa  73.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  30.06 
 
 
296 aa  72.8  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  26.05 
 
 
591 aa  70.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  31.58 
 
 
420 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  32.39 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  32.39 
 
 
304 aa  69.3  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  32.39 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  32.39 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  32.39 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  32.39 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  32.39 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  32.39 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  32.39 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  28.91 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  32.39 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  32.39 
 
 
303 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  28.47 
 
 
518 aa  67.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  33.85 
 
 
480 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  37.37 
 
 
366 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  28.57 
 
 
314 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  30.83 
 
 
420 aa  66.2  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  26.02 
 
 
373 aa  66.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  26.52 
 
 
319 aa  64.3  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  36.63 
 
 
305 aa  62.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.37 
 
 
349 aa  55.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322288  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  23.98 
 
 
337 aa  54.7  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>