112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0796 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  100 
 
 		 847 aa  1692    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  52.3 
 
 		 765 aa  552  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  46.57 
 
 		 776 aa  488  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  45.56 
 
 		 1016 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  43.61 
 
 		 580 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  39.86 
 
 		 772 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  32.63 
 
 		 690 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  35.83 
 
 		 620 aa  282  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  33.52 
 
 		 550 aa  272  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  34.55 
 
 		 580 aa  262  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  33.96 
 
 		 748 aa  244  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  28.82 
 
 		 892 aa  239  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  32.85 
 
 		 576 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  29.98 
 
 		 604 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  31.61 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  31.8 
 
 		 559 aa  215  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  29.79 
 
 		 608 aa  213  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  30.71 
 
 		 567 aa  198  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  28.36 
 
 		 682 aa  191  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  29.76 
 
 		 633 aa  190  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2825  putative vancomycin resistance protein  29.76 
 
 		 652 aa  169  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  26.33 
 
 		 636 aa  137  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  26.68 
 
 		 636 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  24.75 
 
 		 686 aa  125  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  35.71 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  30.79 
 
 		 436 aa  120  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0758  VanW family protein  26.62 
 
 		 1355 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.115824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  33.88 
 
 		 489 aa  115  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  23.35 
 
 		 677 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  23.93 
 
 		 633 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  25.11 
 
 		 569 aa  110  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  29.69 
 
 		 456 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  23.45 
 
 		 670 aa  109  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  23.02 
 
 		 675 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  31.05 
 
 		 435 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  31.28 
 
 		 403 aa  106  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  31.16 
 
 		 503 aa  106  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1425  VanW family protein  22.98 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  29.39 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  32.22 
 
 		 393 aa  102  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  28.81 
 
 		 520 aa  101  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  24 
 
 		 781 aa  101  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  22.58 
 
 		 591 aa  100  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  29.26 
 
 		 510 aa  98.6  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  23.2 
 
 		 594 aa  97.8  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  27.15 
 
 		 467 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  27.35 
 
 		 738 aa  94.4  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  33.09 
 
 		 569 aa  92  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  28.97 
 
 		 565 aa  92  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  25.79 
 
 		 491 aa  90.1  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  24.63 
 
 		 591 aa  90.5  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  32.87 
 
 		 600 aa  89  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  26.54 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  29.09 
 
 		 474 aa  83.2  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  26.32 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  28.69 
 
 		 450 aa  80.5  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  31.44 
 
 		 253 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  26.32 
 
 		 420 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  25.42 
 
 		 420 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  26.32 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  26.32 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  26.32 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  26.32 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  26.32 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  27.73 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  26.85 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  25.88 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  34.09 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  34.38 
 
 		 303 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  34.38 
 
 		 303 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  34.38 
 
 		 303 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  34.38 
 
 		 303 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  29.32 
 
 		 642 aa  77.4  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  34.38 
 
 		 303 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  34.38 
 
 		 303 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  34.38 
 
 		 303 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  34.38 
 
 		 303 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  30.43 
 
 		 219 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  27.05 
 
 		 481 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  34.38 
 
 		 303 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  32.58 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  29.55 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  28.76 
 
 		 439 aa  73.9  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  24.3 
 
 		 520 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  29.01 
 
 		 579 aa  72  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1773  VanW family protein  27.69 
 
 		 301 aa  69.7  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  27.06 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  30.96 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  34.19 
 
 		 480 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  29.58 
 
 		 373 aa  67.4  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  28.16 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  35.51 
 
 		 319 aa  66.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  28.68 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  27.78 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  29.45 
 
 		 366 aa  62  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  31.34 
 
 		 420 aa  60.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  26.26 
 
 		 518 aa  60.1  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  30.6 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0598  VanW family protein  30.89 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  25.98 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>