121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1520 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  100 
 
 
520 aa  1053    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  92.18 
 
 
518 aa  901    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  37.25 
 
 
491 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  34.58 
 
 
458 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  30.23 
 
 
481 aa  219  7e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  29.81 
 
 
467 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  29.69 
 
 
456 aa  194  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  28.97 
 
 
569 aa  193  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  27.81 
 
 
503 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  28.44 
 
 
474 aa  186  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  25.93 
 
 
510 aa  180  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  30.77 
 
 
439 aa  179  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  27.34 
 
 
491 aa  172  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  27.21 
 
 
436 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  30.53 
 
 
420 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  31.93 
 
 
420 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  28.37 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  25 
 
 
520 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  30.1 
 
 
435 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  29.97 
 
 
417 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  29.29 
 
 
420 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  30.16 
 
 
420 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  29.29 
 
 
420 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  29.29 
 
 
420 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  29.29 
 
 
420 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  29.95 
 
 
781 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  28.88 
 
 
420 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  29.02 
 
 
420 aa  150  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  29.07 
 
 
420 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  29.46 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  30.95 
 
 
420 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  26.72 
 
 
373 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  39.16 
 
 
600 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  26.2 
 
 
636 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  31.41 
 
 
591 aa  126  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  33.62 
 
 
319 aa  126  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  25.53 
 
 
636 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  23.9 
 
 
455 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  39.23 
 
 
296 aa  117  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  35.84 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  26.64 
 
 
633 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  28.63 
 
 
686 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  33.02 
 
 
620 aa  113  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  31.25 
 
 
608 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  28.75 
 
 
253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  31.45 
 
 
677 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  31.88 
 
 
565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  33.47 
 
 
303 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  36.3 
 
 
305 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  29.97 
 
 
604 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  33.47 
 
 
303 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  27.96 
 
 
675 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  28.42 
 
 
670 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  29.06 
 
 
642 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  34.25 
 
 
219 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  32.64 
 
 
303 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  38.1 
 
 
303 aa  107  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  32.65 
 
 
303 aa  107  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  38.1 
 
 
303 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  38.1 
 
 
303 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  38.1 
 
 
303 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  38.1 
 
 
303 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  32.65 
 
 
303 aa  106  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  28.68 
 
 
559 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  29.77 
 
 
489 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  31.67 
 
 
304 aa  104  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  40 
 
 
314 aa  103  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  26.18 
 
 
690 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  28.88 
 
 
591 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  30 
 
 
748 aa  100  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  31.18 
 
 
738 aa  100  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  32.27 
 
 
569 aa  99.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  37.24 
 
 
366 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  27.51 
 
 
594 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  29.74 
 
 
248 aa  98.6  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  27.91 
 
 
337 aa  97.1  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  33.98 
 
 
480 aa  96.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  28.57 
 
 
450 aa  95.5  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0964  hypothetical protein  34.31 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  35.21 
 
 
393 aa  95.9  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1425  VanW family protein  27.97 
 
 
617 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  27.84 
 
 
576 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  29.25 
 
 
580 aa  94  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  28.81 
 
 
319 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  25.87 
 
 
580 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  31.28 
 
 
403 aa  92.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  27.49 
 
 
892 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  30 
 
 
567 aa  87.4  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0832  VanW family protein  37.39 
 
 
368 aa  86.7  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  28.65 
 
 
579 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  27.87 
 
 
582 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  34.35 
 
 
772 aa  84.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0758  VanW family protein  26.69 
 
 
1355 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.115824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  29.43 
 
 
550 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3002  vancomycin B-type resistance protein VanW  34.62 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  30.64 
 
 
633 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2239  vancomycin B-type resistance protein VanW  33.85 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00319629  hitchhiker  0.00000191747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1663  VanW family protein  30.26 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  24.17 
 
 
682 aa  77  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5507  VanW family protein  33.85 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.170032 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>