119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0764 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  100 
 
 
129 aa  259  6.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2352  flagellar protein FliS  46.72 
 
 
132 aa  117  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  48.36 
 
 
128 aa  113  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2033  flagellar protein FliS  49.14 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.992226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1628  flagellar protein FliS  51.75 
 
 
138 aa  106  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0836  flagellar protein FliS  45.69 
 
 
137 aa  101  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289358  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31270  flagellar biosynthetic protein FliS  44.74 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2996  flagellar protein FliS  44.74 
 
 
172 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010137 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  37.61 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  38.14 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  37.07 
 
 
133 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  39.64 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  36.52 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  34.19 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  34.82 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  30.91 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  32.26 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  34.82 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  34.82 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  31.82 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  31.9 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  31.9 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  36.94 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  37.38 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  31.13 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  35.83 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  34.78 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  38.14 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  31.67 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  30.25 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0634  flagellar protein FliS  31.36 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323334 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  28.45 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  27.19 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  32.2 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  30.7 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  35.58 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  31.9 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  32.17 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  29.82 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  28.07 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  27.19 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3234  flagellar protein FliS  31.43 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  26.32 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  29.36 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  34.78 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  31.86 
 
 
173 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  32.69 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  30.63 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  30.63 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1338  flagellar protein FliS like protein  37.8 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000272458  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  27.03 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  30 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3849  hypothetical protein  33.65 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  27.97 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  25.44 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  30.63 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  25.44 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  29.52 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  32.11 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2616  flagellar protein FliS like protein  35.37 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2520  flagellar protein FliS like protein  35.37 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00058356  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  28.97 
 
 
135 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  24.56 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0777  flagellar protein FliS  31 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  27.97 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  24.56 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  25.44 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  27.42 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0229  flagellar protein FliS  31.3 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  27.5 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  23.68 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  29.82 
 
 
286 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  30 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0115  flagellar protein FliS  29.84 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.906017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  30.84 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  30.84 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  30.84 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  30.84 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  30.84 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0177  flagellar protein FliS  31.3 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.711098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  23.68 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  28.23 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  29.82 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  30.19 
 
 
145 aa  43.5  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  31.9 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.64 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  24.56 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  22.81 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  29.09 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  23.85 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0091  flagellar protein FliS  29.09 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>