113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2352 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2352  flagellar protein FliS  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  50.78 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  46.72 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0836  flagellar protein FliS  49.17 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2033  flagellar protein FliS  45.52 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.992226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31270  flagellar biosynthetic protein FliS  48.67 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1628  flagellar protein FliS  52.25 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2996  flagellar protein FliS  42.15 
 
 		 172 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  37.17 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  34.51 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  30.97 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  33.06 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  28.95 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  29.55 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  29.55 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  33.91 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  28.1 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  33.62 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  30 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  28.46 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  31.48 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  31.25 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  30.97 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  29.57 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  26.32 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  29.06 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  29.2 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0115  flagellar protein FliS  36.36 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.906017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  31.25 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  29.66 
 
 		 134 aa  57  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  29.46 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  32.46 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  31.58 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  28.07 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  26.67 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  32.71 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  29.82 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  34.23 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 286 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  33.62 
 
 		 301 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  33.64 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  26.72 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  29.73 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  32.43 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0529  flagellar protein FliS  29.6 
 
 		 248 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  30.25 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  31.86 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  31.25 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  29.57 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0777  flagellar protein FliS  32 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  27.27 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  31.4 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  26.96 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  29.2 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  26.05 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  25.66 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  31.25 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  31.25 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  31.25 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  31.25 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  26.55 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  27.78 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  31.53 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  31.53 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  27.27 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1036  flagellar protein FliS  31.96 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242912  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  27.93 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  31.53 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  30.36 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  27.35 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  30.36 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  30.89 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  28.57 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  26.4 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  26.4 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  24.78 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  31.25 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  27.27 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  27.27 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  27.27 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  27.27 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  27.27 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4164  flagellar protein FliS  26.32 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  26.36 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0091  flagellar protein FliS  26.61 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  31.48 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  27.93 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  31.03 
 
 		 275 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  27.78 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1338  flagellar protein FliS like protein  34.94 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000272458  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  27.64 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3234  flagellar protein FliS  26.05 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  22.12 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  27.2 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  24.8 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0869  flagellar protein FliS  24.59 
 
 		 143 aa  42  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  24.8 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>