77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2033 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2033  flagellar protein FliS  100 
 
 
153 aa  315  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.992226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31270  flagellar biosynthetic protein FliS  53.33 
 
 
153 aa  138  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  49.17 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2996  flagellar protein FliS  48.76 
 
 
172 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0836  flagellar protein FliS  42.42 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289358  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2352  flagellar protein FliS  45.52 
 
 
132 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  49.14 
 
 
129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1628  flagellar protein FliS  49.12 
 
 
138 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  33.59 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  32.81 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  37.93 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  38.94 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  31.85 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  35.29 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  30.37 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  36.15 
 
 
133 aa  67  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  33.07 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  31.82 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  31.67 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  29.23 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  35.66 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  34.19 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  29.75 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  28.7 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  32.11 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  31.72 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  31.9 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  27.93 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  29.77 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  35.11 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  30.09 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  31.19 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  26.62 
 
 
149 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  29.73 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  27.21 
 
 
145 aa  51.2  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  26.15 
 
 
136 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0777  flagellar protein FliS  28 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0869  flagellar protein FliS  25 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  26.83 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  28.79 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  26.72 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  27.21 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  25.2 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  29.41 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  32.58 
 
 
141 aa  48.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  26.55 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  29.91 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  29.91 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  27.43 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  27.48 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  30.51 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  27.48 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  30.7 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  29.06 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  26.85 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  30.97 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  30.97 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3234  flagellar protein FliS  26.19 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  29.41 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0091  flagellar protein FliS  29.75 
 
 
129 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  22.52 
 
 
134 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  29.66 
 
 
130 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  28.7 
 
 
128 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  28.18 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  29.66 
 
 
130 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1036  flagellar protein FliS  25.81 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242912  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  30.09 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  27.03 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  28.83 
 
 
286 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  25.95 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0634  flagellar protein FliS  22.54 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  25.95 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3849  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  30.69 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>