197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0557 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  100 
 
 
136 aa  276  7e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  60.29 
 
 
135 aa  168  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  58.33 
 
 
137 aa  154  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  57.58 
 
 
137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  53.33 
 
 
145 aa  136  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  46.96 
 
 
129 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  39.84 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  37.39 
 
 
154 aa  90.5  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  44.92 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  38.13 
 
 
146 aa  90.1  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  45.13 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  39.67 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  38.84 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  40 
 
 
173 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  39.25 
 
 
136 aa  84.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  38.94 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  39.62 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  39.62 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  38.94 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  39.62 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  37.38 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  35.9 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  40.71 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  39.81 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  37.5 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  38.83 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  35.45 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  38.68 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  38.39 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  36.92 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  36.79 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  34.51 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  39.09 
 
 
135 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  39.09 
 
 
135 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  39.09 
 
 
135 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  39.09 
 
 
135 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  39.09 
 
 
135 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  36.79 
 
 
136 aa  77  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  35.85 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  39.45 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  35.4 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  38.71 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0836  flagellar protein FliS  33.05 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289358  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  36.89 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  31.71 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  38.53 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  35.71 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  34.82 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  36.36 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2033  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.992226 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  38.18 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3234  flagellar protein FliS  32.52 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  33.98 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  33.98 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  38.38 
 
 
275 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  34.95 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  36.84 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31270  flagellar biosynthetic protein FliS  32.5 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  34.51 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  34.58 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  36.61 
 
 
286 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  33.02 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  33.98 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  33.98 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  37.27 
 
 
301 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  33.62 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  39.26 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  33.04 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  31.78 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  37.04 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  34.91 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  37.04 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  34.95 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  35.25 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  36.11 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  32.82 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  35.51 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  34.31 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0203  flagellar protein FliS  35.45 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  35.45 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0869  flagellar protein FliS  33.91 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  34.75 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  36.94 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  36.28 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  36.28 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  35.51 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  34.21 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2996  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
172 aa  66.6  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010137 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  35.71 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  35.64 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  36.36 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  34.51 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  31.25 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  32.03 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  31.62 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  34 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  34.51 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  36.45 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>