177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0445 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  100 
 
 
140 aa  286  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  64.18 
 
 
144 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  63.28 
 
 
139 aa  168  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  48.39 
 
 
143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  37.61 
 
 
301 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  37.38 
 
 
136 aa  86.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  39.67 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  35.9 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  35.54 
 
 
173 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  35.51 
 
 
136 aa  84  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  41.84 
 
 
275 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  33.06 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  33.06 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  37.27 
 
 
286 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  33.06 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  31.4 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  31.4 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  34.75 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  35.51 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  33.64 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0529  flagellar protein FliS  33.88 
 
 
248 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  40.34 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  33.64 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  35.51 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  31.36 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  32.71 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  35.77 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  38.83 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  38.83 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  37.9 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  40 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  33.88 
 
 
133 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  35 
 
 
125 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  37.8 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  33.85 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  38.05 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  38.05 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  36.29 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  38.14 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  32.54 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  30.58 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  37.04 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  36.79 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  34.31 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  36.61 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  34.26 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  30.58 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  33.9 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  31.37 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  33.01 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  33.06 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  32.76 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  32.14 
 
 
128 aa  67  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  32.31 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  35.48 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0634  flagellar protein FliS  36.21 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323334 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  35.71 
 
 
136 aa  66.6  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  30.16 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  34.68 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  38.94 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  33.87 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  34.17 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  36.07 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  36.07 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  33.96 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  36.07 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  31.25 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  36.07 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  36.07 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  36.07 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  36.07 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  33.91 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  30.97 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2448  flagellar protein FliS  37.17 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  37.17 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  29.63 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3081  flagellar protein FliS  37.17 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  31.4 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  35.85 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  28.7 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  36.79 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  32.54 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  31.11 
 
 
154 aa  62.8  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  31.82 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  35.4 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  31.82 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  36.36 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2033  flagellar protein FliS  35.66 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.992226 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1148  flagellar protein FliS  32.8 
 
 
125 aa  60.8  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  32.17 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  36.28 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  30.16 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  30.56 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0801  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>