175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2120 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  100 
 
 
301 aa  594  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  53.77 
 
 
275 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  71.33 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0529  flagellar protein FliS  46.85 
 
 
248 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  61.9 
 
 
136 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  37.7 
 
 
144 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  43.48 
 
 
136 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  43.8 
 
 
134 aa  89.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  42.61 
 
 
135 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  39.09 
 
 
140 aa  87  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  44.35 
 
 
132 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  44.35 
 
 
132 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  43.48 
 
 
132 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  33.53 
 
 
173 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  41.46 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  38.98 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  41.32 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  40.18 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  39.81 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  38.35 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  40 
 
 
135 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  39.17 
 
 
134 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  36.36 
 
 
148 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  35.45 
 
 
140 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  38.26 
 
 
135 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
135 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  41.32 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  39.29 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  42.61 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  36.89 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  34.09 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  38.52 
 
 
144 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  31.15 
 
 
136 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  35.25 
 
 
136 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  31.97 
 
 
136 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  31.97 
 
 
136 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  37.61 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  43.88 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  32.79 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  38.02 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  31.97 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  36.89 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  41.67 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  31.97 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  31.15 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  34.51 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  30.33 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  36 
 
 
136 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  32.26 
 
 
143 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  36.59 
 
 
132 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  35.61 
 
 
140 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  40.62 
 
 
130 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  36 
 
 
136 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  36 
 
 
136 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  36.07 
 
 
144 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  36 
 
 
136 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  31.97 
 
 
137 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  35.09 
 
 
141 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  37.5 
 
 
144 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  36 
 
 
136 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  36 
 
 
136 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  35.25 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  36 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  36.36 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  37.27 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  36.36 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  34.21 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  38.78 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  35.45 
 
 
137 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  38.1 
 
 
137 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  36.29 
 
 
146 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  33.62 
 
 
154 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  31.15 
 
 
136 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  33.33 
 
 
139 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  35.2 
 
 
148 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  34.51 
 
 
133 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  34.68 
 
 
135 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  30.33 
 
 
136 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  30.33 
 
 
136 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
133 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  44.09 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  33.12 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
137 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  36.5 
 
 
149 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  39.13 
 
 
154 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
145 aa  65.1  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  31.4 
 
 
126 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4375  flagellar protein FliS  37.27 
 
 
131 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2448  flagellar protein FliS  35.04 
 
 
144 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  31.15 
 
 
133 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  35.04 
 
 
144 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3081  flagellar protein FliS  35.04 
 
 
144 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3637  flagellar protein FliS  37.97 
 
 
126 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  37.96 
 
 
137 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  36.97 
 
 
136 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  37.96 
 
 
137 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>