208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1640 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  100 
 
 
137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  99.27 
 
 
137 aa  270  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  57.58 
 
 
136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  58.33 
 
 
135 aa  150  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  55.75 
 
 
145 aa  135  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  46.56 
 
 
140 aa  100  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  44.74 
 
 
129 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  44.44 
 
 
134 aa  94  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  40 
 
 
140 aa  94  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  40.65 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  39.37 
 
 
133 aa  92  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  33.79 
 
 
154 aa  88.2  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  40.83 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  37.32 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  39.09 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  39.09 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  38.98 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  37.5 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  37.27 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  34.68 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  39.09 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  37.93 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  36.36 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  43.12 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2033  flagellar protein FliS  33.59 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.992226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  36.36 
 
 
138 aa  80.1  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  31.45 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  36.52 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  32.26 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  34.58 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31270  flagellar biosynthetic protein FliS  33.06 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  37.27 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  37.07 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  34.65 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  35.2 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  38.53 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  35.48 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  35.4 
 
 
133 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  35.2 
 
 
136 aa  77  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  35.66 
 
 
173 aa  77  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  38.83 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  37.93 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  39.81 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0836  flagellar protein FliS  32.2 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289358  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  37.27 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  38.89 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  30.89 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  36.84 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  38.05 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  35.51 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  35.29 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  34.23 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  37.86 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  37.86 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  34.58 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3234  flagellar protein FliS  34.15 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  31.36 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  38.89 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  31.36 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  36.36 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  34.21 
 
 
286 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  33.05 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  36.79 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  32.71 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  36.36 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  33.9 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  33.88 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  34.51 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  32.26 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1628  flagellar protein FliS  35.11 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.265718 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  29.41 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  28.81 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  30.58 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  31.78 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  34.82 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  28.81 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  35.45 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  32.76 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  34.82 
 
 
275 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  28.93 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  35.19 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  35.19 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  30 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  35.19 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>