130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0983 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0836  flagellar protein FliS  56.3 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31270  flagellar biosynthetic protein FliS  54.1 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2352  flagellar protein FliS  50.78 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1628  flagellar protein FliS  58.93 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2033  flagellar protein FliS  49.17 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.992226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  48.36 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2996  flagellar protein FliS  43.22 
 
 		 172 aa  102  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010137 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  34.78 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  34.45 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  34.51 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  32.77 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  36.13 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  35.65 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  34.78 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  34.51 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  31.62 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  29.57 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  28.57 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  32.11 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  31.62 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  35.78 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  33.62 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  27.03 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  28.81 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  30 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3234  flagellar protein FliS  34.21 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  32.41 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  33.03 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0115  flagellar protein FliS  36.94 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.906017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  32.69 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  31.78 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  32.71 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  25.21 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0777  flagellar protein FliS  29.13 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  26.79 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  30.48 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  30.33 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  31.82 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  31.82 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  29.66 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  27.12 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  32.43 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  30.7 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  30 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  32.14 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  27.73 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  25.86 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  30.28 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  26.72 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  24.35 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  31.19 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  31.19 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  31.19 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  31.19 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  31.19 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  28.21 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  29.66 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  31.3 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1036  flagellar protein FliS  29.17 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  29.46 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  30.1 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  26.27 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0091  flagellar protein FliS  26.85 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  33.04 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  27.59 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  26.27 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  25.42 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  26.27 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  26.27 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  25.66 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  26.27 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  27.35 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  26.27 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3936  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  28.57 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  29.91 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  25.42 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  28.21 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  25.86 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  26.27 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  26.67 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1148  flagellar protein FliS  28.33 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  29.63 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  27.1 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  30.28 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  32.43 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  31.25 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  25 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  26.27 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>