185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0106 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  100 
 
 
134 aa  275  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  71.64 
 
 
134 aa  199  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  62.61 
 
 
129 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  52.8 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  53.85 
 
 
125 aa  137  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  52.5 
 
 
123 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  48.8 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  53.66 
 
 
129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  37.31 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  45.8 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  43.97 
 
 
126 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  44.07 
 
 
143 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  42.02 
 
 
133 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
130 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  44.83 
 
 
140 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  42.86 
 
 
140 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  40.16 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  42.98 
 
 
154 aa  94.4  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  42.34 
 
 
145 aa  94  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  40 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  40.65 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  39.84 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  38.4 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  42.74 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  46.61 
 
 
146 aa  89  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  40.71 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  38.53 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  35.66 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  35.71 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  35.78 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  35.78 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  33.9 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  33.88 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  33.81 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  33.94 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  32.06 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  33.03 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  33.03 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  32.2 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0836  flagellar protein FliS  32.84 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289358  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31270  flagellar biosynthetic protein FliS  35.14 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2352  flagellar protein FliS  30.97 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  33.96 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  31.93 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3234  flagellar protein FliS  32 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  32.11 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  29.84 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  32.08 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  34.19 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  32.43 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0091  flagellar protein FliS  31.85 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  31.97 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  31.78 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  29.03 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  32.43 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  32.43 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  32.43 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  32.43 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1628  flagellar protein FliS  34.51 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  32.43 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  32.43 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2996  flagellar protein FliS  31.25 
 
 
172 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  34.19 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  31.48 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0203  flagellar protein FliS  35.34 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2033  flagellar protein FliS  29.23 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.992226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  31.48 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  31.13 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  30.91 
 
 
301 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  31.48 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  29.17 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0229  flagellar protein FliS  33.88 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  32.11 
 
 
135 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  31.73 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  31.73 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0177  flagellar protein FliS  33.88 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.711098  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  30.77 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2448  flagellar protein FliS  31.48 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  31.48 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>