183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5255 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  100 
 
 		 144 aa  282  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  73.81 
 
 		 134 aa  189  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  57.26 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  57.26 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  57.26 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  56.8 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  58.54 
 
 		 136 aa  146  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  53.97 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  53.17 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  53.97 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  52.85 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  53.97 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  53.97 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  59.52 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  56.78 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  54.14 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  53.38 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  57.02 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  54.84 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  53.23 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  53.6 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  51.08 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  51.16 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  49.61 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  51.97 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  51.15 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  51.97 
 
 		 144 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  51.97 
 
 		 144 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  51.97 
 
 		 144 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  51.97 
 
 		 144 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  51.97 
 
 		 144 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  51.97 
 
 		 144 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  51.18 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  50.36 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  54.2 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  54.2 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  53.28 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4164  flagellar protein FliS  50.38 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0202  flagellar protein FliS  49.62 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2448  flagellar protein FliS  47.59 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  47.59 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3081  flagellar protein FliS  47.59 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  46.76 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  52 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  46.46 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  41.6 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  41.6 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  41.6 
 
 		 136 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  41.6 
 
 		 136 aa  110  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  41.6 
 
 		 136 aa  110  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  41.6 
 
 		 136 aa  110  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  50.41 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  41.6 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  54.9 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  48.31 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  44.62 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  45.45 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  45.97 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3084  flagellar protein FliS  39.72 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.933377  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  39.86 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  45.83 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  42.65 
 
 		 146 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  43.44 
 
 		 136 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  43.22 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  45.69 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  45.76 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  42.62 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  45.08 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  39.39 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  43.44 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  43.44 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  39.06 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  38.52 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  42.02 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  38.52 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  38.52 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  40.34 
 
 		 133 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  43.44 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  42.74 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  36.76 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  38.52 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  36.89 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  42.31 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  36.89 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  34.92 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  36.13 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  42.74 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  36.07 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  36.97 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  34.92 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  35.07 
 
 		 136 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  35.07 
 
 		 136 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  37.82 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  41.46 
 
 		 301 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  36.13 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  37.41 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3463  flagellar protein FliS  41.46 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.220279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  40.8 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  43.44 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  36.97 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>