181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0055 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  100 
 
 		 126 aa  263  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  84.92 
 
 		 126 aa  229  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3453  flagellar protein FliS  76.19 
 
 		 126 aa  186  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3954  flagellar protein FliS  74.6 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0846761  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3637  flagellar protein FliS  68.25 
 
 		 126 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  50.85 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  50.85 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  45.97 
 
 		 132 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  43.65 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  43.65 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0656  flagellar protein FliS  41.38 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0177  flagellar protein FliS  41.18 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.711098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0229  flagellar protein FliS  41.18 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  39.83 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  36.51 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  36.67 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  36.67 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  36.67 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  36.67 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0206  flagellar protein FliS  39.66 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  36.67 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  37.29 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  33.04 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  35.59 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  35.59 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  35.29 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  32.17 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  35.65 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  33.04 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  36.84 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  36.84 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  36.36 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  34.45 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  37.72 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  36.44 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  34.75 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  34.82 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  35.96 
 
 		 132 aa  87.4  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  34.92 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  35.65 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  35.09 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  32.17 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  31.3 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  31.3 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  34.75 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  32.17 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  30.43 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.54 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  30.43 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3585  flagellar protein FliS  31.4 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  32.46 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  34.48 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  34.48 
 
 		 136 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  33.93 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  26.96 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  26.96 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  26.96 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  26.96 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  26.96 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  31.5 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  31.62 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  30.51 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  31.3 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  26.96 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50250  flagellar protein FliS  37.39 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194402  decreased coverage  0.0000900366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  34.19 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  26.09 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  34.78 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  33.06 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  35.71 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  35.09 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1952  flagellar protein FliS  34.43 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147939  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  31.4 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  34.75 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  31.97 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  34.78 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  32.2 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  34.4 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  34.21 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  32.14 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  31.15 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  34.21 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  33.91 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  33.91 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  33.91 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  33.91 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3463  flagellar protein FliS  32.79 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.220279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  30.58 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  32.17 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  33.62 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  32.14 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3084  flagellar protein FliS  32 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.933377  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  30.33 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  29.17 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  29.27 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>