71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1628 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1628  flagellar protein FliS  100 
 
 		 138 aa  272  9e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31270  flagellar biosynthetic protein FliS  51.02 
 
 		 153 aa  130  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  58.93 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2352  flagellar protein FliS  52.25 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  51.75 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0836  flagellar protein FliS  47.29 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2033  flagellar protein FliS  49.12 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.992226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2996  flagellar protein FliS  47.01 
 
 		 172 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010137 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  35.11 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  35.11 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  34.51 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  35.09 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0115  flagellar protein FliS  38.26 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.906017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  32.2 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  35.14 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  34.44 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  33.87 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  32.28 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  32.82 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  30.91 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  31.3 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  29.55 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0777  flagellar protein FliS  33.9 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  30.51 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  28.12 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  28.57 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  31.31 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  31.48 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  35.16 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  27.93 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  25.86 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  36.05 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  25.4 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1036  flagellar protein FliS  35.79 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  31.78 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  31.16 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  31.78 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  30.65 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  33.86 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  32.52 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  28.32 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  31.2 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  30.47 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0634  flagellar protein FliS  28.21 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323334 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  31.3 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  30.47 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  30.47 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  30.47 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  30.47 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  32.52 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  29.2 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  33.62 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  31.2 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  31.2 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  31.2 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  29.37 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  29.66 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3849  hypothetical protein  32.91 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0203  flagellar protein FliS  30.89 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  33.9 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  31.09 
 
 		 144 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  35.58 
 
 		 144 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 132 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0091  flagellar protein FliS  30.43 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  33.82 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  29.55 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  32.67 
 
 		 301 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  33.87 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>