175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0653 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  100 
 
 
128 aa  258  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  99.22 
 
 
128 aa  257  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  92.97 
 
 
128 aa  246  9e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0763  flagellar protein FliS  73.55 
 
 
123 aa  192  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.392725  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0091  flagellar protein FliS  57.6 
 
 
129 aa  148  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1148  flagellar protein FliS  58.82 
 
 
125 aa  147  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0777  flagellar protein FliS  59.17 
 
 
123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0203  flagellar protein FliS  52.5 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1036  flagellar protein FliS  57.58 
 
 
98 aa  120  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  34.51 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  38.6 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  30.09 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  33.94 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  28.44 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  30.97 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  34.71 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  29.36 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  27.52 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  28.32 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  32.14 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  27.52 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  34.21 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  26.61 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  26.61 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  32.52 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  35.94 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  26.61 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  35.54 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  35.54 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  26.61 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  31.4 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  36.15 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  34.71 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  31.58 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  36.59 
 
 
301 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  31.36 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  27.68 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  31.3 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  35.48 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  31.25 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  35.45 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  28.44 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  32.17 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  30.17 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  35.19 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  31.85 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  30 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  30.3 
 
 
137 aa  60.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.03 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  30.69 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  29.31 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  30.69 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  32.74 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  30.83 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  30 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  34.88 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  32.08 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  30 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
286 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  35.9 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  33.59 
 
 
140 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  33.59 
 
 
140 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  30.36 
 
 
136 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  32.73 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  30.43 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  32.84 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  30.7 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  34.95 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  34.95 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  34.95 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  34.95 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  26.77 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  34.95 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  30.69 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  30.28 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  31.68 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0529  flagellar protein FliS  28.21 
 
 
248 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  32.76 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  34.19 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0869  flagellar protein FliS  32.52 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  29.03 
 
 
132 aa  53.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  27.59 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  27.78 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  28.33 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  33.33 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  29.41 
 
 
132 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0177  flagellar protein FliS  27.42 
 
 
128 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.711098  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  34.31 
 
 
275 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  31.37 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>