193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3036 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  100 
 
 		 144 aa  296  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  64.18 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  64.06 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  47.1 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  38.69 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  39.47 
 
 		 301 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  38.26 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  38.02 
 
 		 173 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  40.35 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  38.6 
 
 		 286 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  36.13 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  34.13 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  36.51 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  33.86 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  33.86 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  38.39 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  37.7 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  31.85 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  33.09 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  33.86 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  37.5 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  34.71 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0529  flagellar protein FliS  36.07 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  31.25 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  34.13 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  39.81 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  37.8 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  39.6 
 
 		 275 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  32.54 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  32.54 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  34.15 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  36.19 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  33.07 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  39.81 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  35.71 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  32.52 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  33.06 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  31.5 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  38.89 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  30.47 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  34.43 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  37.61 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  31.25 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  35.09 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  35 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  35 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  35 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  35.19 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  37.5 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  33.09 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  34.91 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  32.06 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  39.42 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  31.2 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  37.74 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  36.04 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  32.46 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  32.2 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1692  hypothetical protein  28.07 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  31.3 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  37.38 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  37.38 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  33.04 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  31.06 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  31.21 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  36.13 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  35.19 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  37.38 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  37.38 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  37.38 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  37.38 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  37.38 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  31.82 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  30.77 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2448  flagellar protein FliS  36.45 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  32.14 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  36.45 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  31.58 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  35.19 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3081  flagellar protein FliS  36.45 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  35.24 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  32.46 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2352  flagellar protein FliS  33.91 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  34.26 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  27.2 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  35.65 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0763  flagellar protein FliS  32.76 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.392725  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  30.4 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  35.85 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  35.51 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  29.31 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0634  flagellar protein FliS  30.99 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  29.6 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  35.19 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0202  flagellar protein FliS  36.45 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  34.26 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  34.58 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889276 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>