158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0763 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0763  flagellar protein FliS  100 
 
 
123 aa  246  7e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.392725  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  74.38 
 
 
128 aa  194  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  73.55 
 
 
128 aa  192  9e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  73.55 
 
 
128 aa  192  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0777  flagellar protein FliS  60 
 
 
123 aa  142  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1148  flagellar protein FliS  53.78 
 
 
125 aa  134  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0091  flagellar protein FliS  47.97 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1036  flagellar protein FliS  63.16 
 
 
98 aa  122  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242912  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0203  flagellar protein FliS  47.5 
 
 
132 aa  118  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  32.43 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  34.21 
 
 
139 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  35.24 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  31.73 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  31.73 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  28.83 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  31.53 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  34.82 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  28.44 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  31.48 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  37.17 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  27.52 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  28.85 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  30.56 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  27.52 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  32.76 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  36.28 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  33 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  27.52 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  27.88 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  27.88 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  29.36 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  30.63 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  37.84 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  29.63 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  28.7 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  30.48 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  31.86 
 
 
136 aa  57.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  28.18 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  30.97 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  28.91 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  35.4 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  32.48 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  30.1 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  33.62 
 
 
301 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  32.28 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  31.45 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  30.09 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  29.27 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  31.58 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  29.09 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  32.48 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  30.17 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  30.17 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  30.4 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  31.58 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  29.91 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
140 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  31.31 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  28.57 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
140 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  30.7 
 
 
132 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  30.7 
 
 
132 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  30.83 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  30.09 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  30.09 
 
 
134 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  32.04 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  30.19 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  30.19 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  30.19 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  30.19 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  31.03 
 
 
286 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  29.41 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  30.19 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  29.41 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  29.03 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  30.08 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  25.96 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  27.68 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0529  flagellar protein FliS  27.73 
 
 
248 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  28.93 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  27.18 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  29.29 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  26.73 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  29.13 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  28.33 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  28.1 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  31.62 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  30.7 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  29.92 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  33.64 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  31.53 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0869  flagellar protein FliS  30.38 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  28.12 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  30.33 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  26.77 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>