166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0203 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0203  flagellar protein FliS  100 
 
 
132 aa  269  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1148  flagellar protein FliS  53.33 
 
 
125 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  52.5 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0091  flagellar protein FliS  54.17 
 
 
129 aa  127  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0777  flagellar protein FliS  55.93 
 
 
123 aa  128  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  51.67 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  52.1 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0763  flagellar protein FliS  47.5 
 
 
123 aa  118  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.392725  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1036  flagellar protein FliS  53.68 
 
 
98 aa  103  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  35.4 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  34.68 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  29.25 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  35.45 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  31.36 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.54 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  33.02 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  37.37 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  37.5 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  36.28 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  25.69 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  35.34 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  27.73 
 
 
136 aa  62  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  24.77 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  36.04 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  37.1 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  37.04 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  30.71 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  30.71 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  37.37 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  33.06 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  33.62 
 
 
136 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  33.06 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  24.37 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  34.23 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  30 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  35.65 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  29.92 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  25.21 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  29.92 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  29.92 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  29.92 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  25.21 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  25.21 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  36.36 
 
 
131 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  29.92 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  33.06 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  31.62 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  38.38 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  33.07 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  33.87 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  32.54 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  29.31 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  24.37 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  25.24 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  25.24 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  32.28 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  29.57 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  32.54 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  36.97 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  32.79 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  32.28 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  31.58 
 
 
286 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  32.79 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  31.53 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  34.69 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3463  flagellar protein FliS  35.4 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.220279  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  30.08 
 
 
173 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  32.71 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  35.2 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  35.2 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1952  flagellar protein FliS  32.14 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147939  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  31.25 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  31.25 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  31.25 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  31.25 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  32.79 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  30.95 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4375  flagellar protein FliS  32.14 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  31.15 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  34.15 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  35.2 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  30.7 
 
 
301 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  29.6 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  30.08 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  27.18 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  32.32 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>