170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1952 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1952  flagellar protein FliS  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147939  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3463  flagellar protein FliS  92.25 
 
 		 129 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.220279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  75.4 
 
 		 132 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  69.6 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4375  flagellar protein FliS  65.65 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3936  flagellar protein FliS  63.08 
 
 		 133 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3700  flagellar protein FliS  76.19 
 
 		 131 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.687264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  59.52 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  56.45 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  51.26 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  48.78 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  49.17 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  47.5 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50250  flagellar protein FliS  53.97 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194402  decreased coverage  0.0000900366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  42.5 
 
 		 136 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  45 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  45 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  42.5 
 
 		 136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  41.13 
 
 		 136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  50.43 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  42.74 
 
 		 136 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  44.17 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  44.17 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  41.67 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  53.33 
 
 		 137 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  41.67 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  47.54 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  42.5 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  42.5 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  40 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  36.89 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  40.52 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3567  flagellar protein FliS  36.36 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.530482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  36.07 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  35.25 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  36.67 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  38.33 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  44.92 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  43.59 
 
 		 136 aa  87.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  41.67 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  43.22 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  42.37 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  44.07 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  37.19 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  40.17 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  40.17 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  44.07 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  36.36 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  36.36 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  36.36 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  36.36 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  38.84 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  43.22 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  41.53 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  41.53 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  41.53 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  41.53 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  41.53 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  41.53 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  41.53 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  41.53 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  39.67 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  36.59 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  40.68 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  37.19 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  34.43 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  36.89 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3081  flagellar protein FliS  42.37 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2448  flagellar protein FliS  42.37 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  42.37 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  42.4 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  37.98 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  36.75 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  41.32 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  37.61 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  41.32 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  36.75 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  40.48 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  44.54 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  36.75 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  38.84 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0202  flagellar protein FliS  39.32 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  34.75 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  40.17 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2832  flagellar protein FliS  38.89 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0132865 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  35.9 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  35.9 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  35.29 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  35.04 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  36.84 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  36.75 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  40.5 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3084  flagellar protein FliS  38.21 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.933377  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  38.98 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  35.9 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  35.9 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  32.54 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  31.97 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>