168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2415 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  100 
 
 		 129 aa  266  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  50.82 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  53.66 
 
 		 134 aa  130  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  50.41 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  49.17 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  45.45 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  47.5 
 
 		 133 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  41.67 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  42.48 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  39.53 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  39.17 
 
 		 126 aa  91.3  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  38.52 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  36.36 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  37.6 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  37.93 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  37.07 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  35.71 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  38.46 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  35.59 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  35.04 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  32.5 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2033  flagellar protein FliS  37.93 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.992226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  33.87 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  33.87 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  34.19 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  34.09 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  37.61 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  33.62 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  34.51 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  37.1 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  33.61 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  32.23 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  34.86 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31270  flagellar biosynthetic protein FliS  32.76 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  31.5 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  33.94 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  33.94 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  38.79 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  35.54 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  32.23 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  32.17 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2996  flagellar protein FliS  31.3 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010137 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  33.93 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  31.06 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  33.94 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  33.94 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  33.94 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  33.94 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  33.94 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  31.15 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  29.31 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  31.45 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  29.13 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  31.82 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  30.83 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  29.92 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1628  flagellar protein FliS  32.2 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  34.29 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0836  flagellar protein FliS  28.57 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  33.94 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2352  flagellar protein FliS  29.06 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  28.07 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  35.92 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  31.13 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  27.78 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3234  flagellar protein FliS  33.63 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3567  flagellar protein FliS  31.43 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.530482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  33.05 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  28.93 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  30.77 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  30.77 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3084  flagellar protein FliS  36.08 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.933377  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  30.77 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  29.36 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  27.27 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  31.13 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  28.44 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  30.28 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  27.07 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  30.7 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  26.32 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  29.1 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3637  flagellar protein FliS  32.77 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  28.07 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  26.32 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  30.93 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  24.58 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  30.84 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  30.84 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  30.84 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  30.84 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  29.57 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  30.84 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  27.12 
 
 		 152 aa  52.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  30.84 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  30.84 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4164  flagellar protein FliS  28.04 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  26.17 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>